48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02573 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  96.98 
 
 
969 bp  1558    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  95.08 
 
 
969 bp  1423    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  95.08 
 
 
969 bp  1423    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  96.2 
 
 
969 bp  1503    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02573    100 
 
 
894 bp  1772    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  95.08 
 
 
969 bp  1423    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  95.08 
 
 
969 bp  1423    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  96.87 
 
 
969 bp  1550    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03303  transposase  97.67 
 
 
831 bp  1072    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  96.2 
 
 
969 bp  1503    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  96.72 
 
 
870 bp  1259    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  96.98 
 
 
969 bp  1558    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  96.76 
 
 
969 bp  1542    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  97.27 
 
 
660 bp  1166    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  95.08 
 
 
969 bp  1423    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  95.08 
 
 
969 bp  1423    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  96.2 
 
 
969 bp  1503    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  96.64 
 
 
969 bp  1534    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  94.74 
 
 
969 bp  1400    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  95.01 
 
 
783 bp  827    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  95.97 
 
 
969 bp  1487    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00035    96.98 
 
 
894 bp  1558    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  96.17 
 
 
975 bp  1360    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  96.2 
 
 
969 bp  1503    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00374  transposase  96.57 
 
 
495 bp  846    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00375    95.82 
 
 
405 bp  666    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  97.1 
 
 
594 bp  908    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  96.18 
 
 
900 bp  1449    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  96.2 
 
 
969 bp  1503    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  97.2 
 
 
969 bp  1574    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  96.7 
 
 
750 bp  1199    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01253  transposase  95.09 
 
 
480 bp  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  96.45 
 
 
804 bp  622  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02914  transposase  92.23 
 
 
480 bp  509  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  95.95 
 
 
327 bp  410  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02862  transposase  93.39 
 
 
315 bp  375  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04815  transposase  97.42 
 
 
156 bp  276  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04492  transposase, IS30 family  93.26 
 
 
267 bp  272  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02563  transposase  95.74 
 
 
141 bp  224  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04313  transposase  96.19 
 
 
150 bp  176  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 
762 bp  50.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1578 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1491 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>