85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04815 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04815  transposase  100 
 
 
51 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  96.08 
 
 
322 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  96.08 
 
 
299 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  96.08 
 
 
322 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00374  transposase  94.12 
 
 
164 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  94.12 
 
 
322 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  94.12 
 
 
322 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  94.12 
 
 
322 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  92.16 
 
 
322 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  92.16 
 
 
219 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  90.2 
 
 
249 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02563  transposase  95.24 
 
 
46 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04313  transposase  80.49 
 
 
49 aa  68.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  58 
 
 
317 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  91.67 
 
 
324 aa  52  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4598  integrase catalytic region  48 
 
 
336 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  45 
 
 
394 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21080  transposase, IS30 family  46.51 
 
 
453 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.656818  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 
479 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 
479 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 
479 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
474 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
474 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
474 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 
414 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0968  transposase  46.15 
 
 
330 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2165  transposase  46.15 
 
 
330 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1808  transposase  46.15 
 
 
330 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0319  transposase  46.15 
 
 
330 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0221  transposase  46.15 
 
 
330 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  41.46 
 
 
327 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05425  integrase core domain, putative  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03339  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03801  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  43.9 
 
 
315 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04105  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06216  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06099  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04612  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.809805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00937  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 
315 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 
315 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03016  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00950  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01834  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.878416  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01854  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 
356 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  43.9 
 
 
315 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01211  transposase and inactivated derivatives, IS30 family  39.53 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00500  transposase, IS30 family  44.19 
 
 
480 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20930  transpose, IS30 family  44.19 
 
 
480 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>