48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00035 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  97.54 
 
 
969 bp  1598    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  96.76 
 
 
969 bp  1542    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  96.76 
 
 
969 bp  1542    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  98.1 
 
 
969 bp  1637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02573    96.98 
 
 
894 bp  1558    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  96.76 
 
 
969 bp  1542    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  96.76 
 
 
969 bp  1542    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  96.53 
 
 
969 bp  1526    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03303  transposase  97.67 
 
 
831 bp  1072    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  98.1 
 
 
969 bp  1637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  96.58 
 
 
870 bp  1251    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  97.76 
 
 
969 bp  1614    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  97.76 
 
 
969 bp  1614    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  98.94 
 
 
660 bp  1253    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  96.76 
 
 
969 bp  1542    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  96.76 
 
 
969 bp  1542    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  98.1 
 
 
969 bp  1637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  96.31 
 
 
969 bp  1511    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  96.64 
 
 
969 bp  1534    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  97.1 
 
 
783 bp  908    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  98.1 
 
 
969 bp  1637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00035    100 
 
 
894 bp  1772    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  98.27 
 
 
975 bp  1495    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  98.1 
 
 
969 bp  1637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00374  transposase  97.98 
 
 
495 bp  902    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00375    96.56 
 
 
405 bp  690    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  96.91 
 
 
594 bp  900    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  98.61 
 
 
900 bp  1616    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  96.99 
 
 
804 bp  638    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  98.1 
 
 
969 bp  1637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  97.09 
 
 
969 bp  1566    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  98.13 
 
 
750 bp  1279    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01253  transposase  95.82 
 
 
480 bp  666    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02914  transposase  94.1 
 
 
480 bp  565  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  96.8 
 
 
327 bp  432  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02862  transposase  93.82 
 
 
315 bp  387  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04815  transposase  97.42 
 
 
156 bp  276  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04492  transposase, IS30 family  92.75 
 
 
267 bp  264  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02563  transposase  95.04 
 
 
141 bp  216  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04313  transposase  95.24 
 
 
150 bp  168  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3082  integrase catalytic subunit  91.89 
 
 
762 bp  50.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4676  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4673  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0614  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4381  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1578 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.272943  normal  0.570588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4037  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.389495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4112  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1560 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062727  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4295  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
1491 bp  48.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0160339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>