More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0317 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_03351  S-adenosylmethionine synthetase  93.95 
 
 
413 aa  803    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03451  S-adenosylmethionine synthetase  75.56 
 
 
410 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.536517  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1687  S-adenosylmethionine synthetase  74.81 
 
 
409 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03441  S-adenosylmethionine synthetase  87.89 
 
 
413 aa  745    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1869  S-adenosylmethionine synthetase  75.49 
 
 
408 aa  650    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22181  S-adenosylmethionine synthetase  75 
 
 
419 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0466  S-adenosylmethionine synthetase  74.82 
 
 
411 aa  647    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0317  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
413 aa  848    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03361  S-adenosylmethionine synthetase  97.34 
 
 
413 aa  826    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04001  S-adenosylmethionine synthetase  74.81 
 
 
409 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.222949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  67.97 
 
 
421 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  66.01 
 
 
417 aa  559  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  65.26 
 
 
420 aa  545  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  66.01 
 
 
418 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  65.77 
 
 
420 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  66.18 
 
 
422 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  66.18 
 
 
422 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4838  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 
424 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000220213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  58.89 
 
 
397 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  60.19 
 
 
395 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  58.01 
 
 
396 aa  482  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 
403 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 
403 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  57.87 
 
 
396 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  59.81 
 
 
399 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  58.29 
 
 
396 aa  474  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  56.17 
 
 
396 aa  474  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  58.85 
 
 
395 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  58.11 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  59.02 
 
 
399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  57.28 
 
 
399 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  58.62 
 
 
393 aa  468  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  58.6 
 
 
399 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  57.18 
 
 
395 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  57.99 
 
 
408 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  57.93 
 
 
396 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  57.82 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  56.14 
 
 
402 aa  455  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  55.88 
 
 
395 aa  455  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  56.33 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  56.45 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  56.45 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  55.31 
 
 
402 aa  451  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  55.42 
 
 
405 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  56.22 
 
 
410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  55.9 
 
 
388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  54.22 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  53.83 
 
 
396 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  55.85 
 
 
387 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4271  S-adenosylmethionine synthetase  56.05 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268739  decreased coverage  0.00381419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  55.14 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  56.36 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  55.89 
 
 
393 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  54.63 
 
 
393 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  56.11 
 
 
399 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 
393 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  54.89 
 
 
393 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  54.77 
 
 
393 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  55.61 
 
 
387 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  55.16 
 
 
393 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  54.46 
 
 
396 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  54.7 
 
 
396 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  56.78 
 
 
401 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  56.86 
 
 
400 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  54.94 
 
 
417 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  55.81 
 
 
391 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  55.2 
 
 
398 aa  432  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1315  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 
398 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119396  normal  0.284127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  52.96 
 
 
399 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  53.25 
 
 
398 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  53.96 
 
 
393 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  55.39 
 
 
403 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  56.78 
 
 
407 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  55.19 
 
 
393 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  54.48 
 
 
398 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  53.9 
 
 
395 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 
400 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2348  S-adenosylmethionine synthetase  54.85 
 
 
403 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  53.51 
 
 
403 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  54.91 
 
 
388 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  53.2 
 
 
399 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  53.28 
 
 
397 aa  430  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  52.49 
 
 
406 aa  427  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  56.34 
 
 
395 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  56.34 
 
 
395 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  52.74 
 
 
406 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  54.86 
 
 
395 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0194  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
387 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.378325  hitchhiker  0.00256294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  57.95 
 
 
396 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  54.59 
 
 
381 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  56.72 
 
 
396 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  54.41 
 
 
389 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>