More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1687 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_22181  S-adenosylmethionine synthetase  79.75 
 
 
419 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1687  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
409 aa  836    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03441  S-adenosylmethionine synthetase  74.32 
 
 
413 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04001  S-adenosylmethionine synthetase  99.27 
 
 
409 aa  831    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.222949 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1869  S-adenosylmethionine synthetase  79.01 
 
 
408 aa  666    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0466  S-adenosylmethionine synthetase  78.02 
 
 
411 aa  659    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03351  S-adenosylmethionine synthetase  75.37 
 
 
413 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0317  S-adenosylmethionine synthetase  74.81 
 
 
413 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03451  S-adenosylmethionine synthetase  76.47 
 
 
410 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.536517  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03361  S-adenosylmethionine synthetase  74.88 
 
 
413 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  69.06 
 
 
421 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0780  S-adenosylmethionine synthetase  68.84 
 
 
420 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000106532  hitchhiker  0.000013186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1858  S-adenosylmethionine synthetase  68.09 
 
 
422 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1832  S-adenosylmethionine synthetase  68.09 
 
 
422 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2463  S-adenosylmethionine synthetase  66.83 
 
 
417 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.328764  hitchhiker  0.00000000000157811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4661  S-adenosylmethionine synthetase  65.91 
 
 
420 aa  554  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.778397  decreased coverage  0.00341152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3478  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
418 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.575314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4838  S-adenosylmethionine synthetase  69.1 
 
 
424 aa  538  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000220213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  60.29 
 
 
403 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  60.49 
 
 
397 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
399 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
399 aa  488  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
399 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  60.24 
 
 
395 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
399 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
399 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
399 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
399 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  62.07 
 
 
399 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  60.29 
 
 
403 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
399 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  61.82 
 
 
399 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  61.33 
 
 
399 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  57.99 
 
 
396 aa  474  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  58.9 
 
 
396 aa  477  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  58.65 
 
 
395 aa  471  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  57.99 
 
 
396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  58.82 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  57.8 
 
 
396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  59.1 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  58.44 
 
 
393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  58.42 
 
 
399 aa  463  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  55.2 
 
 
395 aa  461  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  57.95 
 
 
408 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  57.7 
 
 
398 aa  458  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  57.7 
 
 
398 aa  458  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  56.11 
 
 
396 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  57.5 
 
 
405 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  56.11 
 
 
396 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 
391 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 
391 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  57.72 
 
 
402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  58.19 
 
 
402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  57.28 
 
 
398 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  55.5 
 
 
402 aa  448  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  56.97 
 
 
388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3103  S-adenosylmethionine synthetase  57.75 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3124  S-adenosylmethionine synthetase  56.54 
 
 
398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  57 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  56.61 
 
 
405 aa  444  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5235  S-adenosylmethionine synthetase  58.06 
 
 
400 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  56.54 
 
 
398 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  55.93 
 
 
399 aa  441  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  55.83 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  56.61 
 
 
405 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  55.61 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  55.58 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  55.39 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  54.74 
 
 
384 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  54.74 
 
 
384 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  54.74 
 
 
384 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  54.74 
 
 
384 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 
403 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  54.74 
 
 
384 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  54.74 
 
 
384 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2575  S-adenosylmethionine synthetase  56.42 
 
 
407 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136519  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  55.64 
 
 
399 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  55.81 
 
 
383 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  56.03 
 
 
387 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  55.83 
 
 
417 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  54.74 
 
 
384 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  55.86 
 
 
414 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  54.74 
 
 
384 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11421  S-adenosylmethionine synthetase  55.94 
 
 
403 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0291702  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0194  S-adenosylmethionine synthetase  58.59 
 
 
387 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.378325  hitchhiker  0.00256294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  55 
 
 
384 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 
403 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  54.74 
 
 
384 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  54.98 
 
 
384 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 
384 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 
384 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  55.06 
 
 
381 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  53.64 
 
 
397 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  55.1 
 
 
391 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3737  S-adenosylmethionine synthetase  54.95 
 
 
402 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.193212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 
410 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 
384 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  56 
 
 
393 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  54.26 
 
 
384 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  55.25 
 
 
397 aa  429  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>