33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88527 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_88527  predicted protein  100 
 
 		 686 aa  1417    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10609  mitochondrial protein Fmp25, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11100)  25.73 
 
 		 575 aa  130  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.730659  normal  0.181462 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07080  hypothetical protein  25.32 
 
 		 559 aa  94.4  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000492685  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  25.54 
 
 		 737 aa  66.6  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.51 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  25.26 
 
 		 461 aa  52.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  25 
 
 		 417 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  24.56 
 
 		 593 aa  51.2  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.82 
 
 		 1919 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.04 
 
 		 692 aa  50.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 2082 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  20.66 
 
 		 818 aa  50.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  27.27 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.62 
 
 		 1679 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  23.31 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  25.12 
 
 		 443 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  21.62 
 
 		 643 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  27.04 
 
 		 558 aa  48.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  21.74 
 
 		 643 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  25.51 
 
 		 403 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  21.2 
 
 		 911 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.74 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  27.01 
 
 		 2367 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.5 
 
 		 821 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.47 
 
 		 570 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  27.43 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  22.06 
 
 		 717 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  25.23 
 
 		 776 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  21.47 
 
 		 743 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  24.05 
 
 		 1129 aa  45.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  24.14 
 
 		 792 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  19.92 
 
 		 418 aa  43.9  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>