35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42812 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC00050  chitin synthase, putative  46.04 
 
 		 1024 aa  663    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881569  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42812  chitin synthase  100 
 
 		 997 aa  2083    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.676694 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07032  Chitin synthase A (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase A)(Class-II chitin synthase A) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30584]  53.61 
 
 		 1013 aa  824    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04566  Chitin synthase C (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase C)(Class-I chitin synthase C) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P30583]  42 
 
 		 918 aa  650    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0856181  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65597  chitin synthase 2  42.49 
 
 		 959 aa  629  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.185541 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02520  chitin synthase 1, putative  43.39 
 
 		 947 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.616261  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51281  chitin synthase 2.2  40.95 
 
 		 1001 aa  585  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29807  chitin synthase  41 
 
 		 866 aa  576  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.532192  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02523  Chitin synthase B (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase B)(Class-III chitin synthase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00757]  40.73 
 
 		 916 aa  551  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.154622 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02110  chitin synthase, putative  43.02 
 
 		 996 aa  541  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04367  chitin synthase 2 (Eurofung)  38.71 
 
 		 905 aa  533  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03240  chitin synthase, putative  40.51 
 
 		 755 aa  512  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00799  conserved hypothetical protein  23.72 
 
 		 797 aa  225  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.70319  normal  0.0518481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3564  bifunctional enzyme including aminotransferase and chitin synthase protein  25.13 
 
 		 641 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2552  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  22.97 
 
 		 1003 aa  127  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1390  chitin synthase  24.22 
 
 		 573 aa  126  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2117  chitin synthase  24.96 
 
 		 628 aa  125  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.110823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  22.3 
 
 		 1023 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37908  transmembrane chitin synthase  26.13 
 
 		 933 aa  89.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01610  chitin synthase-related  32.77 
 
 		 1895 aa  85.5  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01555  Chitin synthase D (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase D)(Class-V chitin synthase D) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P78611]  29.55 
 
 		 1194 aa  80.1  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.058533  normal  0.103858 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44759  transmembrane chitin synthase, glycosaminyl transferas  22.49 
 
 		 904 aa  77.4  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.611486  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29105  chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase 3  26.72 
 
 		 1202 aa  74.3  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.196175  hitchhiker  0.000301151 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04660  chitin synthase 1, putative  26.42 
 
 		 1236 aa  73.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02270  chitin synthase 4, putative  31.16 
 
 		 1423 aa  67.8  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.240777  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06317  Chitin synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2L6A0]  29.79 
 
 		 1739 aa  66.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06318  Chitin synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13281]  29.84 
 
 		 1852 aa  64.7  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05300  chitin synthase 6, putative  31.43 
 
 		 1271 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01046  hypothetical protein similar to chitin synthase class VII (Eurofung)  25 
 
 		 739 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.661748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 1002 aa  50.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 789 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 423 aa  45.8  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 789 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.81 
 
 		 789 aa  45.8  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 423 aa  45.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>