More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33333 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_33333  predicted protein  100 
 
 		 320 aa  644    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.281696 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85379  predicted protein  37.86 
 
 		 902 aa  213  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.403559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  32.37 
 
 		 871 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  32.12 
 
 		 875 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00858  heat shock protein (Eurofung)  29.91 
 
 		 927 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529866  normal  0.100345 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10731  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  30.8 
 
 		 863 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.977517  normal  0.696601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  31.19 
 
 		 871 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  32.79 
 
 		 855 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00690  ATP-dependent chaperone ClpB  31.97 
 
 		 871 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0016  ATPase  31.05 
 
 		 863 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  32.05 
 
 		 876 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3068  ATP-dependent chaperone ClpB  30.5 
 
 		 887 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  31.17 
 
 		 864 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000672053  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06361  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  30.72 
 
 		 863 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  31.85 
 
 		 867 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  31.27 
 
 		 880 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0092  ATP-dependent chaperone protein ClpB  31.35 
 
 		 864 aa  135  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0030598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1456  ATP-dependent chaperone ClpB  31.44 
 
 		 864 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.893525  normal  0.727784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0887  ATP-dependent chaperone ClpB  32.89 
 
 		 854 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.763856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  32.98 
 
 		 859 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7789  chaperone clpB  31.97 
 
 		 876 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150021  normal  0.510261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  31.23 
 
 		 891 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  32.27 
 
 		 865 aa  132  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0823  putative chaperonin clpA/B  32.27 
 
 		 865 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00549001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  32.12 
 
 		 880 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02830  heat shock protein, putative  30.52 
 
 		 898 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0754568  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  31.25 
 
 		 889 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0240  clpB protein  32.04 
 
 		 857 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000492438  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  30.61 
 
 		 883 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  29.63 
 
 		 791 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  32.33 
 
 		 858 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0817  ATP-dependent chaperone ClpB  31.1 
 
 		 859 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.220377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0564  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  31.29 
 
 		 932 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01442  ClpB protein  30.49 
 
 		 824 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  30.66 
 
 		 792 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2439  ATPase AAA-2 domain protein  29.43 
 
 		 440 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4294  ATPase  30.53 
 
 		 871 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0659  ATPase  32.18 
 
 		 848 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  31.63 
 
 		 870 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  30.45 
 
 		 872 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  29.63 
 
 		 791 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  31.91 
 
 		 866 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000923416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  30.13 
 
 		 871 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  31.13 
 
 		 894 aa  129  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000041024  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  30.31 
 
 		 792 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1970  clpB protein  31.91 
 
 		 866 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  32.05 
 
 		 864 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  33.22 
 
 		 857 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2750  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2878  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000852772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02446  hypothetical protein  33.22 
 
 		 857 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000202693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000860565  decreased coverage  0.000000635783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2046  ATP-dependent chaperone ClpB  31.13 
 
 		 871 aa  129  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  31.93 
 
 		 857 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1859  ATP-dependent chaperone ClpB  31.19 
 
 		 868 aa  129  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00600  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  32.29 
 
 		 875 aa  129  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2431  ATP-dependent chaperone ClpB  30.67 
 
 		 865 aa  129  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.500769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  31.31 
 
 		 850 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  29.8 
 
 		 864 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3072  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000111727  normal  0.0172614 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01007  hypothetical protein  31.23 
 
 		 857 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  31.72 
 
 		 862 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1823  ATPase  31.46 
 
 		 860 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  31.43 
 
 		 949 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000839096  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  31.63 
 
 		 859 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2989  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0921142  normal  0.947824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2877  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0185165  normal  0.16875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2772  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000279848  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05550  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  32.28 
 
 		 865 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2875  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0261758  normal  0.114716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2856  protein disaggregation chaperone  33.22 
 
 		 857 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448929  normal  0.22616 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  30.46 
 
 		 862 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0246  ATPase  32.18 
 
 		 848 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0886  protein disaggregation chaperone  32.17 
 
 		 857 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000176912  normal  0.0332416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  30.56 
 
 		 872 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  31.54 
 
 		 814 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3720  ATP-dependent chaperone ClpB  33.57 
 
 		 857 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00907871  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1959  ATPase AAA-2  31.72 
 
 		 862 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199054  normal  0.312929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0130  ATPase AAA-2  30.33 
 
 		 872 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  30.67 
 
 		 862 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  30.1 
 
 		 874 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0876  ATPase  30.82 
 
 		 862 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0495  ATP-dependent chaperone ClpB  28.89 
 
 		 873 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  30.79 
 
 		 949 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5381  ATP-dependent chaperone ClpB  31.33 
 
 		 878 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24612  chaperone, Hsp100 family, ClpB-type  31.19 
 
 		 923 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.311804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  31.46 
 
 		 894 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  31.11 
 
 		 949 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0085  ATP-dependent chaperone ClpB  31.19 
 
 		 872 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.802904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0684  ATPase AAA-2 domain protein  32.28 
 
 		 841 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  29.88 
 
 		 818 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11960  ATP-dependent protease  32.27 
 
 		 854 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  29.6 
 
 		 867 aa  126  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3203  ATPase AAA-2 domain protein  31.08 
 
 		 853 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38530  ATP-dependent chaperone ClpB  31.27 
 
 		 873 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  29.56 
 
 		 815 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>