252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54748 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_54748  divalent cation transporter  100 
 
 
499 aa  1006    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0387661  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42927  predicted protein  58.96 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00363535  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  34.71 
 
 
447 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0946  magnesium transporter  31.43 
 
 
457 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1095  magnesium transporter  31.43 
 
 
457 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20606  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  34.08 
 
 
452 aa  90.1  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  31.93 
 
 
447 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  27.12 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  35.09 
 
 
446 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0419  magnesium transporter  35.54 
 
 
455 aa  86.7  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  31.55 
 
 
449 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  32.45 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  25.88 
 
 
441 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  25.88 
 
 
441 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  32.42 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0507  hypothetical protein  30.87 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.593937 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  32.34 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  33.53 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  31.55 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  30.2 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1523  magnesium transporter  35.36 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  29.94 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  30.86 
 
 
449 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  26.85 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  28.43 
 
 
460 aa  80.1  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  31.95 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  30.68 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  29.14 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2531  MgtE integral membrane region  28.07 
 
 
339 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.540183  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4616  magnesium transporter  30.6 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  decreased coverage  0.00267397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  32.34 
 
 
450 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  32.64 
 
 
454 aa  79  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  32.62 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  28.49 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  29.41 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  28.33 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  27.12 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  32 
 
 
457 aa  77  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  33.14 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  30.22 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  33.14 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  29.41 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  33.14 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  33.14 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  28.96 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  28.73 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  30.6 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  29.73 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  31.15 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1068  magnesium transporter  31.49 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  23.46 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  31.98 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1398  magnesium transport protein  31.94 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  29.73 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  31.89 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  33.14 
 
 
457 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  29.94 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  29.94 
 
 
444 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  31.14 
 
 
452 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  33.33 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  30.6 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  29.96 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  32.56 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0051  magnesium transporter  26.54 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  29.96 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  31.03 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  29.44 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  32.75 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  29.34 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  28.87 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  29.51 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  33.14 
 
 
457 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002597  Mg2+ transporter mgtE  31.64 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00102897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  29.21 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04510  Mg2+ transporter MgtE  29.38 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  30.51 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  26.52 
 
 
456 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  28.99 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1260  magnesium transporter  25.94 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  26.52 
 
 
456 aa  68.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  28.57 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2496  magnesium transporter  32.33 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03411  magnesium transport protein  31.79 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5582  magnesium transporter  27.93 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  29.21 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2441  magnesium transporter  31.07 
 
 
460 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  27.68 
 
 
460 aa  66.6  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0914  magnesium transporter  29.38 
 
 
460 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10367  Mg2+ transport transmembrane protein mgtE  29.01 
 
 
460 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.54721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  25.82 
 
 
460 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  27.22 
 
 
450 aa  64.7  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  28.96 
 
 
465 aa  64.7  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
446 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  28.96 
 
 
465 aa  64.7  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  29.86 
 
 
453 aa  64.3  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  27.22 
 
 
454 aa  64.3  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2606  MgtE integral membrane region  27.08 
 
 
419 aa  63.9  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.679505  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  28.21 
 
 
445 aa  63.9  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  25.14 
 
 
458 aa  63.9  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2187  magnesium transporter  32.16 
 
 
461 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183067  normal  0.0149882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>