285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48636 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48636  glutathione peroxidase domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  369  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  40.99 
 
 
158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  39.51 
 
 
162 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  38.12 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  37.5 
 
 
165 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  38.12 
 
 
159 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  41.61 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  38.12 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  38.12 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  38.65 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  38.36 
 
 
159 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  38.36 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  38.36 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  38.36 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  38.36 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  38.36 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2176  glutathione peroxidase  46.09 
 
 
143 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0884553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  38.36 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  38.36 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  37.34 
 
 
164 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  37.27 
 
 
158 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  35.95 
 
 
162 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  37.27 
 
 
161 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  36.25 
 
 
158 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  36.65 
 
 
165 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  36.65 
 
 
165 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  37.25 
 
 
164 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  37.04 
 
 
158 aa  101  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  36.65 
 
 
165 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  35.62 
 
 
159 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  35.58 
 
 
164 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  35.62 
 
 
159 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  36.88 
 
 
161 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  35.62 
 
 
159 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  37.11 
 
 
165 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  35.62 
 
 
159 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  35.8 
 
 
162 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  34.52 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  38.56 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  37.42 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  35.37 
 
 
165 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  34.78 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  35.37 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  39.33 
 
 
162 aa  99.4  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  35.76 
 
 
161 aa  99  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  37.27 
 
 
158 aa  99  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  34.78 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  34.16 
 
 
161 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  35 
 
 
159 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  35.76 
 
 
161 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  36.25 
 
 
158 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  34.38 
 
 
159 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  36.88 
 
 
163 aa  98.2  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  35.8 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  34.38 
 
 
161 aa  97.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  34.13 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  39.22 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  34.59 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2006  glutathione peroxidase family protein  44.35 
 
 
160 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  35 
 
 
159 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  36.65 
 
 
158 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  34.87 
 
 
167 aa  95.9  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  34.78 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  36.84 
 
 
158 aa  94.4  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  36.88 
 
 
158 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  33.75 
 
 
161 aa  94  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2146  Peroxiredoxin  34.36 
 
 
160 aa  94.4  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  34.97 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2947  glutathione peroxidase  32.53 
 
 
167 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.781382  hitchhiker  0.0011995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  35.62 
 
 
161 aa  93.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2662  glutathione peroxidase  32.61 
 
 
181 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0111206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  33.75 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  31.68 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  31.68 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  31.68 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  35.1 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  43.36 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  35.71 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  42.61 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  35.4 
 
 
160 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  35.06 
 
 
162 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  31.68 
 
 
160 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52875  Hydroperoxide resistance conferring gene. Sensor and transducer of the hydroperoxide signal to Yap1. Hydroperoxide receptor and redox-transducer  35.62 
 
 
185 aa  92  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.187379  normal  0.741014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  31.68 
 
 
160 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  33.12 
 
 
160 aa  92  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  31.06 
 
 
160 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  35.71 
 
 
162 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  33.76 
 
 
160 aa  91.7  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  31.06 
 
 
160 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  35.98 
 
 
159 aa  91.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  31.06 
 
 
160 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  31.06 
 
 
161 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  31.06 
 
 
160 aa  91.3  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  42.24 
 
 
161 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2171  glutathione peroxidase  42.24 
 
 
161 aa  90.9  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0779752 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  35.8 
 
 
158 aa  90.9  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  32.92 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2663  glutathione peroxidase  37.04 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  41.86 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  32.91 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0609505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>