More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26201 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_26201  predicted protein  100 
 
 
426 aa  890    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449308  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  45.53 
 
 
248 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  46.56 
 
 
306 aa  237  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  50.45 
 
 
253 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  50.92 
 
 
249 aa  229  8e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  48.42 
 
 
247 aa  226  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  50.23 
 
 
249 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.75 
 
 
250 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  46.43 
 
 
252 aa  223  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  44.2 
 
 
248 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 
247 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  47.3 
 
 
247 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 
249 aa  219  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  47.51 
 
 
247 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  44.17 
 
 
248 aa  218  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  48.65 
 
 
247 aa  217  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  46.4 
 
 
247 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
248 aa  214  2.9999999999999995e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  46.54 
 
 
601 aa  213  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  43.25 
 
 
247 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  46.29 
 
 
248 aa  213  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  47.49 
 
 
251 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  45.25 
 
 
251 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  44.59 
 
 
248 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  44.39 
 
 
250 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  45.25 
 
 
250 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  46.79 
 
 
232 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 
250 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  47.3 
 
 
270 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  44.8 
 
 
251 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  46.4 
 
 
247 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  48.86 
 
 
247 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  47.3 
 
 
270 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
247 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 
245 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.85 
 
 
248 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  44.64 
 
 
246 aa  209  7e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.79 
 
 
237 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  46.58 
 
 
248 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  47.3 
 
 
248 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 
249 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 
293 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
248 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
270 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  46.4 
 
 
248 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
270 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  42.5 
 
 
248 aa  207  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  44.14 
 
 
249 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 
249 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  45.66 
 
 
247 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  44.14 
 
 
248 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  44.14 
 
 
247 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  45.7 
 
 
234 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  44.34 
 
 
248 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
248 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  45.05 
 
 
249 aa  208  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  44.5 
 
 
230 aa  208  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 
245 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  43.44 
 
 
250 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
249 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
249 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
249 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
249 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
249 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  43.44 
 
 
250 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  45.95 
 
 
248 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
249 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  46.19 
 
 
229 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
249 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  44.64 
 
 
246 aa  207  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33839  predicted protein  41.7 
 
 
282 aa  207  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  42.99 
 
 
250 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  42.74 
 
 
249 aa  206  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  42.99 
 
 
250 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  43.95 
 
 
250 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  43.44 
 
 
248 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 
245 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  42.53 
 
 
250 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.27 
 
 
245 aa  206  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  46.79 
 
 
248 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  45.7 
 
 
247 aa  206  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  46.36 
 
 
247 aa  206  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  46.12 
 
 
250 aa  206  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  45.29 
 
 
234 aa  206  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 
246 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  44.98 
 
 
251 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  43.24 
 
 
245 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0402  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.45 
 
 
255 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  45.05 
 
 
248 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  44.14 
 
 
249 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.41 
 
 
250 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>