More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_22974 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05626  Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1)(Acetate--CoA ligase)(Acyl-activating enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16928]  50.38 
 
 
670 aa  655    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0101756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  50.92 
 
 
657 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  52.5 
 
 
644 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  50.15 
 
 
662 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1791  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 
650 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  53.83 
 
 
648 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  51.17 
 
 
650 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  50.78 
 
 
653 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  49.84 
 
 
652 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1399  acetate--CoA ligase  50.93 
 
 
653 aa  647    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570682  normal  0.412853 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  52.08 
 
 
653 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  52.34 
 
 
645 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 
651 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  52.66 
 
 
645 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  51.77 
 
 
653 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  52.5 
 
 
644 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1479  acetyl-CoA synthetase  51.09 
 
 
651 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.341037  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00711  acetyl-coenzyme A synthetase (Acetate--CoA ligase) (Acyl-activating enzyme)  51.1 
 
 
648 aa  644    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  49.77 
 
 
661 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 
650 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4701  acetyl-CoA synthetase  51.41 
 
 
644 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120403  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  50.54 
 
 
646 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2558  acetyl-CoA synthetase  51.01 
 
 
650 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  48.46 
 
 
652 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  51.31 
 
 
652 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  50.62 
 
 
649 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  51.24 
 
 
645 aa  637    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  51.56 
 
 
645 aa  653    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  50.77 
 
 
647 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  51.99 
 
 
645 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  51.09 
 
 
650 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2725  acetyl-CoA synthetase  51.25 
 
 
650 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.469585  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2532  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 
650 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165664  hitchhiker  0.000575675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 
650 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 
650 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  51.66 
 
 
647 aa  680    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1863  acetyl-CoA synthetase  51.17 
 
 
650 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.579141  normal  0.108064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  51.91 
 
 
652 aa  645    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22974  acetate-coa, ligase  100 
 
 
675 aa  1404    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4783  acetyl-CoA synthetase  49.62 
 
 
649 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  49.84 
 
 
644 aa  637    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  51.01 
 
 
645 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  52.51 
 
 
654 aa  674    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0731  acetyl-CoA synthetase  51.76 
 
 
644 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40572  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  51.48 
 
 
650 aa  646    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  51.32 
 
 
650 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 
645 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  51.35 
 
 
651 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42750  acetyl-CoA synthetase  50.94 
 
 
645 aa  651    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.74253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  51.09 
 
 
651 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  52.29 
 
 
645 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  51.77 
 
 
653 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  51.5 
 
 
650 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  52.5 
 
 
644 aa  672    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  51.48 
 
 
650 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34530  acetyl-CoA synthetase  51.09 
 
 
653 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  52.07 
 
 
651 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  52.07 
 
 
651 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  51.09 
 
 
651 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 
650 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  51.01 
 
 
650 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  50.53 
 
 
649 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3553  acetyl-coenzyme A synthetase  50.45 
 
 
658 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  50.93 
 
 
649 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5208  acetyl-CoA synthetase  49.62 
 
 
649 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 
651 aa  634  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  49.77 
 
 
661 aa  634  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 
651 aa  634  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  49.54 
 
 
652 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  52.09 
 
 
645 aa  635  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
651 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  50.86 
 
 
649 aa  634  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
654 aa  635  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2952  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 
649 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002199  acetyl-coenzyme A synthetase  50.39 
 
 
650 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2494  acetyl-CoA synthetase  49.38 
 
 
649 aa  635  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4670  acetyl-CoA synthetase  48.75 
 
 
652 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  50.47 
 
 
653 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3992  acetyl-CoA synthetase  50.47 
 
 
653 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733733  normal  0.105895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3776  acetyl-CoA synthetase  50.78 
 
 
653 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.800941  hitchhiker  0.000764225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  50.39 
 
 
651 aa  631  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0053  acetyl-CoA synthetase  49.53 
 
 
645 aa  629  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  49.69 
 
 
667 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  50.47 
 
 
653 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00169  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 
682 aa  631  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0209  acetyl-CoA synthetase  50.47 
 
 
650 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  50.55 
 
 
648 aa  631  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2562  acetyl-CoA synthetase  48.91 
 
 
649 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.732738  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
651 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3835  acetyl-CoA synthetase  48.61 
 
 
652 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415539  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3921  acetyl-CoA synthetase  48.61 
 
 
652 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4535  acetyl-CoA synthetase  48.59 
 
 
652 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3260  acetyl-CoA synthetase  49.38 
 
 
653 aa  626  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2785  acetyl-CoA synthetase  48.54 
 
 
652 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.301549  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4528  acetyl-CoA synthetase  48.59 
 
 
652 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855103  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  50 
 
 
647 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3947  acetyl-CoA synthetase  48.77 
 
 
652 aa  626  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.903736  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5598  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 
648 aa  628  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438623  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  49.62 
 
 
644 aa  625  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  50.54 
 
 
650 aa  628  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0282682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>