71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0101 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_3552  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain-containing protein  81.7 
 
 		 399 aa  697    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.935534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0742  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  82.1 
 
 		 401 aa  704    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1394  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  86.36 
 
 		 401 aa  742    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2254  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  84.81 
 
 		 402 aa  716    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4214  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  84.13 
 
 		 397 aa  725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.14758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1359  coenzyme F420 hydrogenase  77.78 
 
 		 401 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1364  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  86.36 
 
 		 401 aa  742    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0101  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  100 
 
 		 397 aa  832    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353763 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36251  predicted protein  48.89 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0805225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3479  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  41.67 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4023  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  37.78 
 
 		 410 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1791  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  40.86 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3777  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  36.72 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0498224  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1245  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  36.65 
 
 		 409 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  unclonable  0.0000000241639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3268  putative coenzyme F420 hydrogenase  37.8 
 
 		 409 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.96965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1688  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  37.01 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43972  predicted protein  39.22 
 
 		 536 aa  286  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0188  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  35.99 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0937  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  36.29 
 
 		 410 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0952  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  38.03 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.529831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0603  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  35.7 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.110275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2739  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  36.46 
 
 		 391 aa  259  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0300  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  34.79 
 
 		 412 aa  259  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0696  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  37.69 
 
 		 352 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1640  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  36.13 
 
 		 419 aa  233  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.326327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0646  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  31.93 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0174  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.07 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.318509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2329  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  27.85 
 
 		 288 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0076  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  30.67 
 
 		 282 aa  101  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2290  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  28.33 
 
 		 291 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.107219 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0193  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  31.54 
 
 		 282 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0449  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  29.58 
 
 		 291 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0695  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  29.88 
 
 		 282 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.507932  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0630  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  30.71 
 
 		 282 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.9157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2177  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  25.85 
 
 		 298 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1288  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  30.71 
 
 		 282 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0087  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  26.89 
 
 		 291 aa  93.6  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127818  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0012  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  28.03 
 
 		 290 aa  93.2  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1042  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  29.58 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0476  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  24.41 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.601068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0255  F420H2 dehydrogenase subunit F  26.27 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  24.64 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  22.18 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0331  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.64 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0881  coenzyme F420 hydrogenase, beta subunit  23.05 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1150  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.16 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  24.51 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0783  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  23.75 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00366682  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1303  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.27 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.808254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  22.57 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1693  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  26.94 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.884047  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.93 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2707  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  28.38 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.889848  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0662  coenzyme F420 hydrogenase beta subunit  24.8 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0964  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  24 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0422  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  26.12 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.664623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1334  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  19.43 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1095  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.18 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  22.38 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1081  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.98 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0866  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.18 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.161905  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1595  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.27 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.502541  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0242  Coenzyme F420 hydrogenase  20.97 
 
 		 538 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  25.56 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4135  hypothetical protein  22.19 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.45 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1144  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.11 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.592396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3038  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  19.91 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1138  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.97 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  21.6 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>