74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1640 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1640  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  100 
 
 		 419 aa  849    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.326327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3777  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  67.77 
 
 		 410 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0498224  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4023  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  67.6 
 
 		 410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1245  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  65.47 
 
 		 409 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  unclonable  0.0000000241639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1688  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  65.47 
 
 		 409 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3268  putative coenzyme F420 hydrogenase  62.94 
 
 		 409 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.96965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0937  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  65.54 
 
 		 410 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0300  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  57 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1359  coenzyme F420 hydrogenase  38.18 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4214  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  36.91 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.14758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0101  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  36.13 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2254  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  36.39 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1364  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  34.99 
 
 		 401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1394  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  34.99 
 
 		 401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0742  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  34.55 
 
 		 401 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3552  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain-containing protein  36.15 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.935534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3479  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  35.01 
 
 		 429 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0188  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.89 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36251  predicted protein  32.17 
 
 		 428 aa  209  5e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0805225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2739  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  32.7 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1791  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  31.36 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803312  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0603  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  30.34 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.110275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0952  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  31.15 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.529831  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43972  predicted protein  30.05 
 
 		 536 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0696  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  28.91 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0255  F420H2 dehydrogenase subunit F  23.08 
 
 		 346 aa  96.3  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  24.06 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0174  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  28.19 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.318509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0087  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  27.4 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127818  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2177  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  26.91 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0331  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  28.79 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2329  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  25.68 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0012  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  24.59 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2707  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  28.12 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.889848  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1693  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  29.02 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.884047  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0476  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  25.1 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.601068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0662  coenzyme F420 hydrogenase beta subunit  25.37 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0881  coenzyme F420 hydrogenase, beta subunit  22.17 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0646  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  23.72 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0449  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  24.31 
 
 		 291 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0783  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.38 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00366682  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  21 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0964  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  26.8 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.61 
 
 		 618 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0076  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  23.63 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2892  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  26 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1288  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  24.8 
 
 		 282 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.48 
 
 		 498 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2290  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  22.94 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.107219 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0630  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  24.4 
 
 		 282 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.9157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1150  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.08 
 
 		 364 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0193  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  25.3 
 
 		 282 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1042  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  23.65 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.88 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4481  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.7 
 
 		 418 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0462  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  26.29 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.522633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  20.85 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1058  hypothetical protein  24.71 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.550841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  26.56 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1378  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  26.27 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2944  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  22.75 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1380  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.47 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0924  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  31.3 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000725534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1832  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  28.67 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4135  hypothetical protein  24.74 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1081  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  21.77 
 
 		 359 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1562  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  30 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0242  Coenzyme F420 hydrogenase  23.83 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2346  Formate dehydrogenase  27.85 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1814  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.88 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1044  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  27.16 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0606051  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0177  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.48 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1334  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  23.95 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  31.82 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>