66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0422 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0422  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  100 
 
 		 355 aa  733    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.664623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1150  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  39.28 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0174  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  27.24 
 
 		 362 aa  117  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.318509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0881  coenzyme F420 hydrogenase, beta subunit  29.69 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.15 
 
 		 618 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0783  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.65 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00366682  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1095  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.6 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1693  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.84 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.884047  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1081  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.4 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0662  coenzyme F420 hydrogenase beta subunit  25.79 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  28.3 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0866  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.77 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.161905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0331  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.62 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1303  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  26.25 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.808254  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0646  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  27.54 
 
 		 282 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1595  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.93 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0255  F420H2 dehydrogenase subunit F  23.66 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1334  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.85 
 
 		 396 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0076  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  28 
 
 		 282 aa  92.8  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0964  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  27.01 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1042  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  28 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1288  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  28.86 
 
 		 282 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0630  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  27.86 
 
 		 282 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.9157 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0695  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  27.85 
 
 		 282 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.507932  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2707  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.23 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.889848  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0193  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  27.27 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0012  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  24.91 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0476  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  24.02 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.601068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  25.97 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2329  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  26.97 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0087  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  26.73 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127818  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2177  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  27.5 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3479  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  30.99 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0449  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  26.27 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.39 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  22.47 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.15 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2290  coenzyme F420-reducing hydrogenase subunit beta  24.66 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.107219 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  21.96 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0242  Coenzyme F420 hydrogenase  24.16 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3268  putative coenzyme F420 hydrogenase  37.74 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.96965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4214  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  27.57 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.14758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0101  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  26.12 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1359  coenzyme F420 hydrogenase  25.32 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0177  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.84 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0742  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.26 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.14 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.848293  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2254  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.69 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3777  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  27.57 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0498224  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  23.51 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3552  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain-containing protein  25.81 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.935534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4023  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  28.4 
 
 		 410 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1364  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  22.3 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3038  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.48 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1245  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.05 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  unclonable  0.0000000241639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1394  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  22.3 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1688  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.68 
 
 		 409 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 118 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.910611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2944  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.45 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 		 92 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0826775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  22.22 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0087  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.92 
 
 		 114 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0087  hydrogenase, Fe-only  28.46 
 
 		 567 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4135  hypothetical protein  24.17 
 
 		 440 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2365  glycyl-radical enzyme activating protein family  44 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000514278  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2086  ferredoxin  32.61 
 
 		 128 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>