46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_50510  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4302  hypothetical protein  92.38 
 
 		 105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19660  hypothetical protein  68.32 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1388  hypothetical protein  62.86 
 
 		 105 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3844  hypothetical protein  63.37 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4107  hypothetical protein  64 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1249  hypothetical protein  61.62 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  61.7 
 
 		 102 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2754  hypothetical protein  56.12 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  61.29 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  59.57 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  59.57 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  59.57 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  58.51 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  61.29 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  57.45 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  57.45 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  57.45 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1708  hypothetical protein  54.26 
 
 		 203 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.864506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0801  hypothetical protein  54.26 
 
 		 164 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1315  hypothetical protein  54.26 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0556  hypothetical protein  54.26 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.613658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0597  hypothetical protein  54.26 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0971212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1508  hypothetical protein  54.26 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1537  hypothetical protein  54.26 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4275  hypothetical protein  55.21 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1176  hypothetical protein  52.48 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1142  hypothetical protein  52.48 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1159  hypothetical protein  51.49 
 
 		 104 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714067  normal  0.0517845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  46.39 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  46.46 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  43 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  48.96 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  44.57 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  40.59 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1679  CBS  37.76 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  39.33 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  32.14 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  35.9 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  34.62 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  29.63 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  30.77 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  33.73 
 
 		 95 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1820  hypothetical protein  29.76 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.758746  normal  0.0254268 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2964  hypothetical protein  37.04 
 
 		 107 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>