39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2003 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  99.03 
 
 
103 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2010  hypothetical protein  54.84 
 
 
111 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2733  hypothetical protein  56.99 
 
 
97 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1820  hypothetical protein  47.31 
 
 
102 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.758746  normal  0.0254268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  43.59 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  36.56 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  37.18 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  34.41 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  40.7 
 
 
95 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2964  hypothetical protein  38.46 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  29.67 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  28.57 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  28.26 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  33.33 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  31.11 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  28.26 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  34.07 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3844  hypothetical protein  32.97 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1558  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  25.81 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  30 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4107  hypothetical protein  30.53 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  30.77 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  27.78 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  26.67 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  26.67 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  26.67 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1249  hypothetical protein  30.77 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1388  hypothetical protein  30.11 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  28.89 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  28.89 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  30.77 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1142  hypothetical protein  30.43 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4302  hypothetical protein  34.43 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1176  hypothetical protein  30.43 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417835  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19660  hypothetical protein  27.47 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4275  hypothetical protein  30.43 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694483  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1159  hypothetical protein  28.28 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714067  normal  0.0517845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50510  hypothetical protein  36.07 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>