21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2964 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2964  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  214  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  52.22 
 
 
97 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  51.14 
 
 
95 aa  94  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  46.59 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  46.24 
 
 
100 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  47.31 
 
 
100 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1820  hypothetical protein  39.8 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.758746  normal  0.0254268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2733  hypothetical protein  41.3 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2010  hypothetical protein  39.78 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  38.46 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  38.46 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  33.75 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  35.9 
 
 
114 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  32.58 
 
 
101 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  34.83 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  34.83 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  35.96 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  34.83 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  35.96 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1388  hypothetical protein  33.73 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  34.83 
 
 
118 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>