18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1820 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1820  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  204  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.758746  normal  0.0254268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2010  hypothetical protein  55.88 
 
 
111 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2733  hypothetical protein  53.19 
 
 
97 aa  114  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  42.27 
 
 
97 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  47.31 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  47.31 
 
 
103 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  37.23 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  42.55 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  42.55 
 
 
100 aa  87.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2964  hypothetical protein  39.8 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  35.79 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  30.85 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  29.89 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  29.49 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  32.91 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  27.96 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  29.07 
 
 
104 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  31.11 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>