39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0103 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  200  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  88 
 
 		 100 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  55.21 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  53.68 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  53.68 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2964  hypothetical protein  47.31 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1820  hypothetical protein  42.55 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.758746  normal  0.0254268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2733  hypothetical protein  43.62 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2010  hypothetical protein  41.05 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  36.56 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  36.56 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  34.41 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  38.75 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  37.18 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  28.26 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  35.44 
 
 		 106 aa  47.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  28.57 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  35.9 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  34.18 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  28.21 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2754  hypothetical protein  32.91 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  28.72 
 
 		 117 aa  42  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0597  hypothetical protein  32.05 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0971212  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  32.05 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0556  hypothetical protein  32.05 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.613658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1315  hypothetical protein  32.05 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1537  hypothetical protein  32.05 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1508  hypothetical protein  32.05 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4275  hypothetical protein  32.1 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4302  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1176  hypothetical protein  32.95 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417835  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0801  hypothetical protein  32.05 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1142  hypothetical protein  32.95 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>