46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0834 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  93.22 
 
 
118 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  88.03 
 
 
132 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  92.59 
 
 
108 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  88.79 
 
 
107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2754  hypothetical protein  79.09 
 
 
138 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1708  hypothetical protein  81.13 
 
 
203 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.864506  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0556  hypothetical protein  85.57 
 
 
105 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.613658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1315  hypothetical protein  85.57 
 
 
105 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0801  hypothetical protein  81.13 
 
 
164 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0597  hypothetical protein  85.57 
 
 
105 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0971212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1508  hypothetical protein  85.57 
 
 
105 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1537  hypothetical protein  85.57 
 
 
105 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  77.32 
 
 
102 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  77.08 
 
 
105 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  75.79 
 
 
117 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1249  hypothetical protein  58.51 
 
 
101 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1388  hypothetical protein  57.45 
 
 
105 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19660  hypothetical protein  54.17 
 
 
106 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4107  hypothetical protein  49.07 
 
 
104 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3844  hypothetical protein  53.19 
 
 
101 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1558  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1142  hypothetical protein  51.06 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4275  hypothetical protein  52.75 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1176  hypothetical protein  51.06 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417835  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1159  hypothetical protein  48.94 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714067  normal  0.0517845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50510  hypothetical protein  57.45 
 
 
105 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  43.48 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  41.41 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  41.3 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4302  hypothetical protein  55.32 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  48.91 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  40.22 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1679  CBS  37.5 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  44.58 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  38.64 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  35 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  35 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  29.63 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  26.67 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2964  hypothetical protein  34.83 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  25.56 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2733  hypothetical protein  27.94 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  30.95 
 
 
95 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>