37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1708 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1708  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.864506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0801  hypothetical protein  93.71 
 
 
164 aa  323  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2754  hypothetical protein  91.24 
 
 
138 aa  255  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0597  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0971212  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0556  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.613658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1315  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1537  hypothetical protein  99.05 
 
 
105 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1508  hypothetical protein  99.05 
 
 
105 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  79.28 
 
 
118 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  81.13 
 
 
106 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  81.13 
 
 
116 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  81.13 
 
 
116 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  78.7 
 
 
132 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  79.44 
 
 
107 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  79.63 
 
 
108 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  74.29 
 
 
102 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  73.79 
 
 
117 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  70.48 
 
 
105 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19660  hypothetical protein  51.04 
 
 
106 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1249  hypothetical protein  53.19 
 
 
101 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1388  hypothetical protein  53.19 
 
 
105 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4107  hypothetical protein  47 
 
 
104 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3844  hypothetical protein  48.94 
 
 
101 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1558  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1142  hypothetical protein  47 
 
 
125 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1159  hypothetical protein  48.94 
 
 
104 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714067  normal  0.0517845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4275  hypothetical protein  49.46 
 
 
103 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1176  hypothetical protein  49.46 
 
 
103 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417835  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  42.16 
 
 
106 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50510  hypothetical protein  54.26 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1679  CBS  37.76 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  42.05 
 
 
125 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4302  hypothetical protein  49.35 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  41.76 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  45.12 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  43.18 
 
 
101 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  43.68 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  37.5 
 
 
104 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>