44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1293 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  92.16 
 
 
102 aa  190  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  84.62 
 
 
117 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  73.15 
 
 
132 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  79.17 
 
 
107 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  79.17 
 
 
108 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  72.9 
 
 
118 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  77.08 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  77.08 
 
 
116 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  77.08 
 
 
106 aa  153  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2754  hypothetical protein  71.15 
 
 
138 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1708  hypothetical protein  70.48 
 
 
203 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.864506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0597  hypothetical protein  70.48 
 
 
105 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0971212  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1315  hypothetical protein  70.48 
 
 
105 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0556  hypothetical protein  70.48 
 
 
105 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.613658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1508  hypothetical protein  70.48 
 
 
105 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1537  hypothetical protein  70.48 
 
 
105 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0801  hypothetical protein  70.48 
 
 
164 aa  148  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19660  hypothetical protein  59.38 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1388  hypothetical protein  60.22 
 
 
105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1249  hypothetical protein  54.84 
 
 
101 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4107  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3844  hypothetical protein  52.69 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1558  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4275  hypothetical protein  51.06 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694483  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1142  hypothetical protein  51.06 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1176  hypothetical protein  51.06 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417835  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  47.47 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50510  hypothetical protein  61.29 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1159  hypothetical protein  48.94 
 
 
104 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714067  normal  0.0517845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  46.74 
 
 
114 aa  87  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  45.65 
 
 
106 aa  87  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  48.89 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  40.95 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4302  hypothetical protein  59.14 
 
 
105 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  50.6 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1679  CBS  37 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  41.18 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  40 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  30.53 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  30 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  28.89 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  32.91 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>