41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1142 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1142  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1176  hypothetical protein  99.03 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4275  hypothetical protein  96.12 
 
 		 103 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1159  hypothetical protein  89.32 
 
 		 104 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714067  normal  0.0517845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1249  hypothetical protein  56.57 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1388  hypothetical protein  55.1 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4107  hypothetical protein  55.45 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3844  hypothetical protein  55.45 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  51.06 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  51.06 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  51.06 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  51.61 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  51.06 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  52.13 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2754  hypothetical protein  48 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  51.06 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  51.06 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19660  hypothetical protein  46.53 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0801  hypothetical protein  47 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1708  hypothetical protein  47 
 
 		 203 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.864506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1508  hypothetical protein  47 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0597  hypothetical protein  47 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0971212  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1537  hypothetical protein  47 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0556  hypothetical protein  47 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.613658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1315  hypothetical protein  47 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  51.06 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  51.06 
 
 		 102 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4302  hypothetical protein  52.94 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50510  hypothetical protein  52.48 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  38.54 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  38.04 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  37.62 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  34.74 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1679  CBS  28.43 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  34.15 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  29.55 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  31.33 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  30.43 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  30.43 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  32.95 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>