44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2843 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  204  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  92.16 
 
 		 105 aa  190  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  87.25 
 
 		 117 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  76.24 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  76.24 
 
 		 108 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  77.32 
 
 		 116 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  77.32 
 
 		 116 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  78.35 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  77.32 
 
 		 106 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  78.35 
 
 		 107 aa  156  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2754  hypothetical protein  75.25 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1708  hypothetical protein  74.29 
 
 		 203 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.864506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0801  hypothetical protein  74.29 
 
 		 164 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1315  hypothetical protein  74.29 
 
 		 105 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0556  hypothetical protein  74.29 
 
 		 105 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.613658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0597  hypothetical protein  74.29 
 
 		 105 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0971212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1508  hypothetical protein  75.25 
 
 		 105 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362713  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1537  hypothetical protein  75.25 
 
 		 105 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19660  hypothetical protein  57.29 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1388  hypothetical protein  59.57 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.283816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1249  hypothetical protein  55.32 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4107  hypothetical protein  54.26 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3844  hypothetical protein  54.26 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50510  hypothetical protein  61.7 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1142  hypothetical protein  51.06 
 
 		 125 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4275  hypothetical protein  52.75 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1176  hypothetical protein  52.75 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1159  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0714067  normal  0.0517845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  47.47 
 
 		 101 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4302  hypothetical protein  59.57 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  45.65 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  42.42 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  48.84 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  46.67 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1679  CBS  39 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  42.16 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  39.24 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  35.9 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  35.9 
 
 		 100 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  28.42 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  30.77 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  29.67 
 
 		 103 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  32.91 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>