41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0085 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  199  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  88 
 
 		 100 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  56.25 
 
 		 97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  56.84 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  53.68 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2964  hypothetical protein  46.24 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1820  hypothetical protein  42.55 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.758746  normal  0.0254268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2010  hypothetical protein  44.21 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2733  hypothetical protein  43.62 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  34.41 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  34.41 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  34.62 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  38.75 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  34.62 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  30.3 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  31.63 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  35.44 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  35 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1200  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  34.18 
 
 		 107 aa  47.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4458  hypothetical protein  35 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  35.9 
 
 		 102 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  27.78 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1722  Protein of unknown function DUF2288  32.05 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.599277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19660  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  32.91 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2754  hypothetical protein  33.73 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4302  hypothetical protein  43.1 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3844  hypothetical protein  32.05 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4107  hypothetical protein  32.05 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0801  hypothetical protein  32.93 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0597  hypothetical protein  32.93 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0971212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1708  hypothetical protein  32.93 
 
 		 203 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.864506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1537  hypothetical protein  32.93 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1508  hypothetical protein  32.93 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0556  hypothetical protein  32.93 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.613658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1315  hypothetical protein  32.93 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50510  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  40  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>