27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0126 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0126  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0433115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3327  hypothetical protein  67.37 
 
 		 97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0283  hypothetical protein  62.11 
 
 		 100 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0085  hypothetical protein  53.68 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.13816e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0103  hypothetical protein  53.68 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000166984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2964  hypothetical protein  51.14 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2733  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  84.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1820  hypothetical protein  35.79 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.758746  normal  0.0254268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2010  hypothetical protein  41.49 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2003  hypothetical protein  40.7 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2028  uncharacterized small conserved protein  40.7 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1257  hypothetical protein  34.62 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0160  hypothetical protein  32.05 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0240  Protein of unknown function DUF2288  29.79 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3667  hypothetical protein  28.89 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3056  hypothetical protein  26.6 
 
 		 114 aa  48.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2154  hypothetical protein  25.56 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0897  hypothetical protein  34.15 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1293  hypothetical protein  32.91 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1993  hypothetical protein  33.73 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19660  hypothetical protein  31.65 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2843  hypothetical protein  32.91 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.786388  normal  0.508501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1225  hypothetical protein  33.73 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1297  hypothetical protein  31.33 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1315  hypothetical protein  30.95 
 
 		 116 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50510  hypothetical protein  40.74 
 
 		 105 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0834  hypothetical protein  30.95 
 
 		 116 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>