93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04601 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_04601  putative recombination protein O  100 
 
 		 259 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04491  putative recombination protein O  79.77 
 
 		 261 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.741842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  80.16 
 
 		 261 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  78.6 
 
 		 261 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03961  putative recombination protein O  52.53 
 
 		 266 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1733  putative recombination protein O  52.59 
 
 		 266 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.615018  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04501  putative recombination protein O  51.39 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21431  putative recombination protein O  48.64 
 
 		 267 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2015  DNA replication and repair protein RecO  45.49 
 
 		 257 aa  229  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0656  recombination protein O, RecO  44.71 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  35 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  34.8 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  28.35 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  31.79 
 
 		 296 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  28.14 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  27.76 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  35.26 
 
 		 283 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  29.28 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  23.9 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  23.66 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  25.39 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  28.19 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  38.16 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  35.14 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  21.18 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  31.25 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  23.51 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  25.93 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  23.41 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  32.89 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  33.67 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  27.83 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  24.54 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  27.91 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  27.91 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  29.46 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  27.91 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  23.12 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  27.91 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  27.91 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  27.91 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  32.47 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  35.53 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  27.13 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  34.21 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  29.57 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  37.66 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  28.16 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  29.33 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  29.33 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  29.33 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  29.33 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  34.67 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  32.89 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  21.18 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  28 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  30.26 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  31.71 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  27.35 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  22.98 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  29.33 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  30.49 
 
 		 243 aa  45.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  32 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  29 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0317  Recombination protein O RecO  28.4 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.44578 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  26.14 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  26.38 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  25.53 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  34.21 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  29.47 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  28.05 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  26.35 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  24.86 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  23.7 
 
 		 248 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  23.7 
 
 		 248 aa  42  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  25.84 
 
 		 241 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>