37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2015 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2015  DNA replication and repair protein RecO  100 
 
 		 257 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0656  recombination protein O, RecO  80.16 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21431  putative recombination protein O  69.11 
 
 		 267 aa  315  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03961  putative recombination protein O  55.08 
 
 		 266 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1733  putative recombination protein O  48.84 
 
 		 266 aa  252  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.615018  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04501  putative recombination protein O  49.02 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04601  putative recombination protein O  45.49 
 
 		 259 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  46.06 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04491  putative recombination protein O  46.25 
 
 		 261 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.741842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  45.85 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  30.66 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  30.39 
 
 		 293 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  33.99 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  32.84 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  32.46 
 
 		 273 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  25.86 
 
 		 296 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  32.21 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  24.58 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  28.3 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  26.87 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  24.69 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  26.51 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  25.59 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  26.73 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  25.86 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  28.46 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  27.61 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  26.25 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  27.88 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  29.48 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  25.49 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  27.2 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  26.24 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  30.1 
 
 		 244 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  29.61 
 
 		 253 aa  42  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>