59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21431 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_21431  putative recombination protein O  100 
 
 		 267 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03961  putative recombination protein O  59.77 
 
 		 266 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2015  DNA replication and repair protein RecO  69.38 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0656  recombination protein O, RecO  68.22 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1733  putative recombination protein O  53.82 
 
 		 266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.615018  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04501  putative recombination protein O  54.3 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  50.39 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04491  putative recombination protein O  50.39 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.741842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  50.39 
 
 		 261 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04601  putative recombination protein O  48.64 
 
 		 259 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  33.09 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  32.71 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  35.68 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  33.16 
 
 		 288 aa  99  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  34.62 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  33.17 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  31.03 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  25.25 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  27.71 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  28.83 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  29.45 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  26.21 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  31.67 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  28.65 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  37.33 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  24.54 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  26.15 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  28.83 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  31.85 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  31.68 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  29.66 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  31.09 
 
 		 250 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  25.61 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  28.04 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  27.16 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  33.77 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  33.77 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  27.61 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  33.77 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  25.68 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  32.47 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  24.5 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  32.47 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  27.22 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  25.58 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  36.11 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  31.17 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  33.77 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  32.52 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  24.83 
 
 		 217 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  25.23 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  32.52 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  31.37 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  34.94 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>