51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0656 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0656  recombination protein O, RecO  100 
 
 		 257 aa  497  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2015  DNA replication and repair protein RecO  80.16 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21431  putative recombination protein O  67.95 
 
 		 267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03961  putative recombination protein O  54.55 
 
 		 266 aa  295  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04501  putative recombination protein O  51.97 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1733  putative recombination protein O  50.97 
 
 		 266 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.615018  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  47.62 
 
 		 261 aa  251  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04491  putative recombination protein O  47.62 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.741842  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04601  putative recombination protein O  44.71 
 
 		 259 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  47.01 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  34.34 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  33.96 
 
 		 273 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  31.88 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  35.26 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  31.61 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  31.66 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  30.73 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  30.65 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  26.82 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  25.32 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  26.46 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  27.01 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  29.45 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  24.07 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  21.12 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  36 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  25.34 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  30.46 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  32.89 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  24.14 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  25.47 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  27.93 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  30.25 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  25.91 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  28.52 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  25.47 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  23.48 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  23.48 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  23.48 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  23.48 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  23.48 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  23.48 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  23.48 
 
 		 248 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  42  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 248 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  29.13 
 
 		 244 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>