54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0317 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0317  Recombination protein O RecO  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.44578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  30.95 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  29.84 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  31.71 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  31.2 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  26.14 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 		 273 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  33.06 
 
 		 293 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  29.58 
 
 		 336 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  32.28 
 
 		 266 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  32.28 
 
 		 238 aa  48.5  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  29.58 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 275 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 275 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 275 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 275 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 275 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 		 302 aa  48.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 286 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 286 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  29.79 
 
 		 286 aa  47.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  28.68 
 
 		 254 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  28.67 
 
 		 278 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  29.37 
 
 		 256 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  28.67 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  28.67 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  28.17 
 
 		 306 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  28.17 
 
 		 309 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  28.67 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  28.67 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  35.14 
 
 		 273 aa  45.8  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  27.45 
 
 		 283 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  28.17 
 
 		 279 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  31.13 
 
 		 252 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  28.17 
 
 		 279 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  28 
 
 		 257 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04601  putative recombination protein O  28.4 
 
 		 259 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  26.38 
 
 		 250 aa  44.7  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  28.37 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  32.28 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  30.89 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  24.69 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04491  putative recombination protein O  24.69 
 
 		 261 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.741842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  25.31 
 
 		 261 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  25.52 
 
 		 298 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  26.95 
 
 		 253 aa  42  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  26.76 
 
 		 272 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  31.03 
 
 		 296 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  26.76 
 
 		 273 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  26.76 
 
 		 273 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  22.44 
 
 		 250 aa  40.8  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>