148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1659 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1659  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 95 aa  194  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4352  Smr protein/MutS2  60.47 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.41095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4369  Smr protein/MutS2  56.98 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0240999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4375  Smr protein/MutS2  60 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.188101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2727  Smr protein/MutS2  56.82 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.455627  normal  0.0813442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4219  Smr protein/MutS2-like  57.83 
 
 		 86 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0936467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1296  Smr protein/MutS2-like  57.65 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000154426  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1444  Smr protein/MutS2  54.35 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  51.11 
 
 		 486 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0385  Smr protein/MutS2  45.45 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  41.77 
 
 		 793 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  42.5 
 
 		 789 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  39.24 
 
 		 792 aa  62.8  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  40 
 
 		 796 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  40 
 
 		 828 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  41.77 
 
 		 786 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  37.97 
 
 		 791 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  49.18 
 
 		 787 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.77 
 
 		 792 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  50 
 
 		 786 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  50 
 
 		 786 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  47.62 
 
 		 778 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  45.16 
 
 		 791 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  44.74 
 
 		 775 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  38.16 
 
 		 806 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0755  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.84 
 
 		 740 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0617391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  48.1 
 
 		 782 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.51 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  39.29 
 
 		 765 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.47 
 
 		 784 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.75 
 
 		 782 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.77 
 
 		 786 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  36.71 
 
 		 796 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  46.77 
 
 		 771 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  40.54 
 
 		 784 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  43.75 
 
 		 800 aa  53.9  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  38.82 
 
 		 826 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.24 
 
 		 782 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.24 
 
 		 782 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  41.94 
 
 		 785 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  35.06 
 
 		 781 aa  53.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  36.84 
 
 		 818 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  48.05 
 
 		 785 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  46.88 
 
 		 780 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  42.11 
 
 		 792 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1087  Smr protein/MutS2  38.67 
 
 		 817 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  39.74 
 
 		 801 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  41.03 
 
 		 788 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  50 
 
 		 783 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  35.9 
 
 		 791 aa  52  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.71 
 
 		 782 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0458  MutS family ATPase  35 
 
 		 795 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  38.16 
 
 		 785 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  46.27 
 
 		 796 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  50 
 
 		 783 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  37.78 
 
 		 789 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  35 
 
 		 757 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  35 
 
 		 757 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0496  Smr protein/MutS2  42.11 
 
 		 817 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00013691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  32.91 
 
 		 780 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  43.24 
 
 		 776 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2422  DNA mismatch repair protein MutS-like  35.71 
 
 		 796 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  33.77 
 
 		 783 aa  50.1  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  35.23 
 
 		 771 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1719  MutS2 family protein  35.06 
 
 		 779 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  38.16 
 
 		 791 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  36.36 
 
 		 805 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  32.47 
 
 		 769 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  38.67 
 
 		 767 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_002936  DET0959  Smr domain-containing protein  32.63 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  34.18 
 
 		 779 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  35.21 
 
 		 820 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  34.67 
 
 		 804 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1441  Smr protein/MutS2  34.52 
 
 		 796 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  41.27 
 
 		 761 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3253  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  44.83 
 
 		 750 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  38.16 
 
 		 793 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0384  MutS2 family protein  36.14 
 
 		 840 aa  46.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_832  Smr domain protein  31.58 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000202387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  31.58 
 
 		 804 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1155  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.71 
 
 		 731 aa  46.2  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00051962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0850  Smr protein/MutS2  31.58 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  35.14 
 
 		 803 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0248  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.71 
 
 		 734 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0633  Smr protein/MutS2  30.23 
 
 		 266 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3443  hypothetical protein  31.4 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.98 
 
 		 830 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  44.44 
 
 		 803 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0624  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  33.33 
 
 		 733 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0203068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.98 
 
 		 830 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>