117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0959 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0959  Smr domain-containing protein  100 
 
 
100 aa  205  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00245853  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_832  Smr domain protein  98 
 
 
102 aa  202  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000202387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0850  Smr protein/MutS2  96 
 
 
102 aa  200  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  43.82 
 
 
786 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  43.82 
 
 
786 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  42.86 
 
 
793 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  38.64 
 
 
786 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  40.91 
 
 
796 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2046  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.37 
 
 
791 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  40 
 
 
792 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  41.67 
 
 
787 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  43.68 
 
 
792 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.78 
 
 
792 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1732  Smr protein/MutS2  42.68 
 
 
796 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1308  MutS2 family protein  41.46 
 
 
778 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1373  MutS2 family protein  46.15 
 
 
784 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1493  MutS2 family protein  41.98 
 
 
757 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1541  MutS2 family protein  42.5 
 
 
757 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0230  MutS2 family protein  40.48 
 
 
789 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000337666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  43.9 
 
 
785 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  41.86 
 
 
785 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  43.68 
 
 
791 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1638  MutS2 family protein  39.71 
 
 
782 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00924497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  40 
 
 
828 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.53 
 
 
786 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  42.35 
 
 
775 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0153  MutS2 family protein  38.1 
 
 
796 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323958  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0734  MutS2 family protein  43.02 
 
 
780 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.11062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.11 
 
 
784 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1336  MutS2 family protein  43.68 
 
 
781 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.37 
 
 
786 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.37 
 
 
786 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.37 
 
 
786 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.37 
 
 
786 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.37 
 
 
786 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.37 
 
 
786 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.37 
 
 
786 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.37 
 
 
786 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  41.18 
 
 
826 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  48.19 
 
 
801 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.53 
 
 
786 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  36.36 
 
 
782 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  39.53 
 
 
786 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1829  Smr protein/MutS2  40 
 
 
804 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  36.9 
 
 
780 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  38.75 
 
 
750 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2459  Smr protein/MutS2  38.55 
 
 
765 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  38.75 
 
 
776 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2782  MutS2 family protein  38.64 
 
 
785 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.23 
 
 
782 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  35.23 
 
 
782 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2225  Smr protein/MutS2  38.96 
 
 
793 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1568  MutS2 family protein  35.56 
 
 
763 aa  57  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  34.94 
 
 
761 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  33.71 
 
 
776 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.56 
 
 
782 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0668  Smr protein/MutS2  37.97 
 
 
794 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.529959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1356  MutS2 family protein  43.33 
 
 
794 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0999  Smr protein/MutS2  29.76 
 
 
769 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  37.21 
 
 
783 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0899  MutS2 family protein  34.57 
 
 
789 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.733658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  37.21 
 
 
783 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0299  MutS2 family protein  36.49 
 
 
803 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  40 
 
 
806 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2680  mismatch repair ATPase  35.71 
 
 
788 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1368  Smr protein/MutS2  32.89 
 
 
771 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0447  DNA mismatch repair protein MutS-like  42.67 
 
 
789 aa  52.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1155  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  34.52 
 
 
731 aa  52.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00051962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.03 
 
 
857 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1087  Smr protein/MutS2  33.33 
 
 
817 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  37.66 
 
 
791 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0634  MutS2 family protein  31.46 
 
 
779 aa  51.6  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3771  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.03 
 
 
830 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4901  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  42.86 
 
 
803 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  41.1 
 
 
820 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3820  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.03 
 
 
830 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2054  DNA mismatch repair protein MutS-like  31.33 
 
 
771 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1689  Smr protein/MutS2  38.89 
 
 
793 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123598  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1972  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.33 
 
 
774 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.656834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2338  MutS2 family protein  33.33 
 
 
774 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0730  MutS2 family protein  32.89 
 
 
804 aa  50.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2920  Smr protein/MutS2  32.5 
 
 
792 aa  50.1  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000870196 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1450  MutS2 family protein  35.29 
 
 
818 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0624  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  32.95 
 
 
733 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0203068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  37.18 
 
 
788 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0496  Smr protein/MutS2  34.21 
 
 
817 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00013691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0268  Smr protein/MutS2  32.1 
 
 
805 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0912246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4299  MutS2 family protein  32.91 
 
 
812 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  34.57 
 
 
800 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5711  MutS2 family protein  33.33 
 
 
824 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1659  Smr protein/MutS2  32.63 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1152  MutS2 family protein  38.16 
 
 
757 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5060  MutS2 family protein  33.33 
 
 
802 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  31.4 
 
 
783 aa  47.4  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1457  Smr protein/MutS2  29.07 
 
 
805 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1897  MutS2 family protein  30.86 
 
 
767 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.557227  normal  0.0324553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  40.98 
 
 
486 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2648  DNA-mismatch repair protein  30.14 
 
 
797 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.270427  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0683  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  28.12 
 
 
735 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1920  MutS2 family protein  34.38 
 
 
760 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.380002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>