189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0798 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0798  Smr protein/MutS2  100 
 
 		 486 aa  989    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4871  hypothetical protein  28.21 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362055  hitchhiker  0.00000195031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1305  hypothetical protein  29.05 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2598  hypothetical protein  30.5 
 
 		 358 aa  147  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5006  hypothetical protein  28.05 
 
 		 363 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2408  hypothetical protein  27.44 
 
 		 358 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2956  hypothetical protein  25.76 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.962807  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1833  hypothetical protein  26.76 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4455  hypothetical protein  25.07 
 
 		 367 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3162  hypothetical protein  25.41 
 
 		 358 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2128  hypothetical protein  28.83 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.777089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0422  hypothetical protein  23.17 
 
 		 381 aa  103  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4369  Smr protein/MutS2  49.45 
 
 		 105 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0240999 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1454  hypothetical protein  28.4 
 
 		 361 aa  94.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0672806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2727  Smr protein/MutS2  52.27 
 
 		 110 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.455627  normal  0.0813442 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3151  hypothetical protein  24.69 
 
 		 365 aa  93.6  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1659  Smr protein/MutS2  51.11 
 
 		 95 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4352  Smr protein/MutS2  45.16 
 
 		 104 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.41095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0175  hypothetical protein  24.55 
 
 		 358 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.103811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1671  hypothetical protein  25.07 
 
 		 381 aa  86.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.670148  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4375  Smr protein/MutS2  44.09 
 
 		 104 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.188101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4219  Smr protein/MutS2-like  46.91 
 
 		 86 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0936467  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15611  hypothetical protein  24.92 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1444  Smr protein/MutS2  44.21 
 
 		 133 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1296  Smr protein/MutS2-like  51.85 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000154426  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0385  Smr protein/MutS2  43.42 
 
 		 85 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1046  hypothetical protein  25.45 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00909472  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0092  hypothetical protein  21.58 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1203  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.25 
 
 		 782 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1225  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.25 
 
 		 782 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0727  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  43.75 
 
 		 782 aa  67.8  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1710  MutS2 family protein  44.58 
 
 		 820 aa  67  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.261707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0547  MutS2 family protein  42.2 
 
 		 792 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4014  MutS2 family protein  47.37 
 
 		 828 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.301308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4891  MutS2 family protein  38.46 
 
 		 806 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1642  MutS2 family protein  44.16 
 
 		 787 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000590377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0062  MutS2 family protein  50 
 
 		 826 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21825  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05680  MutS2 family protein  41.25 
 
 		 791 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  44.74 
 
 		 792 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1108  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.19 
 
 		 782 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0684525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0545  MutS2 family protein  46.67 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.807648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  34.83 
 
 		 776 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1155  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.16 
 
 		 731 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00051962  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0248  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  31.58 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0755  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.84 
 
 		 740 aa  56.6  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0617391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1412  MutS2 family protein  42.86 
 
 		 783 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29197e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0696  Smr protein/MutS2  35.45 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.648126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1813  MutS2 family protein  36.71 
 
 		 796 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.572275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4285  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4296  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4076  Smr protein/MutS2-like  39.08 
 
 		 278 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1711  MutS2 family protein  39.53 
 
 		 801 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000187694  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4665  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000565535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0934  Smr protein/MutS2  39.08 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0494  Smr protein/MutS2  39.08 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0973  Smr protein/MutS2  39.08 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000221381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0576  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4662  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0676128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4678  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0381928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3655  MutS2 family protein  41.94 
 
 		 780 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4447  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2798  MutS2 family protein  28.99 
 
 		 783 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4794  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.167233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4380  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2632  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  40.79 
 
 		 784 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0176007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3240  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  46.77 
 
 		 786 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2974  MutS 2 protein  48.39 
 
 		 785 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0494  Smr protein/MutS2  34.74 
 
 		 733 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0426  mismatch repair ATPase  42.11 
 
 		 791 aa  54.7  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00172781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0935  MutS2 family protein  46.03 
 
 		 785 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  41.33 
 
 		 783 aa  54.3  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2154  Smr protein/MutS2  38.37 
 
 		 221 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  0.857394 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0611  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  38.1 
 
 		 796 aa  53.9  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.651644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2558  Smr protein/MutS2  38.37 
 
 		 221 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2425  Smr protein/MutS2  36.78 
 
 		 292 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3301  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  41.77 
 
 		 857 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0896287  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1014  MutS2 family protein  37.5 
 
 		 793 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0625051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2125  MutS2 family protein  52.38 
 
 		 776 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0988  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.53 
 
 		 735 aa  52.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0845  Smr protein/MutS2  37.93 
 
 		 259 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0538  MutS2 family protein  40 
 
 		 791 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00387352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2343  hypothetical protein  37.21 
 
 		 221 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.160848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2390  MutS2 family protein  36.25 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0786061  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2135  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.5 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1847  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  37.5 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1717  MutS family ATPase  42.5 
 
 		 800 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2935  MutS2 family protein  41.77 
 
 		 788 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2696  hypothetical protein  36.47 
 
 		 234 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2124  Smr domain-containing protein  34.09 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0481849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3080  Smr domain-containing protein  34.09 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1559  Smr domain-containing protein  34.09 
 
 		 247 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16681  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0624  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  29.41 
 
 		 733 aa  51.6  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0203068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1470  MutS2 family protein  39.47 
 
 		 792 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.471316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3340  Smr protein/MutS2  35.29 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0178748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3452  Smr protein/MutS2  34.44 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0788  Smr domain-containing protein  34.09 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.156735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2620  Smr domain-containing protein  34.09 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482206  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2992  Smr domain-containing protein  34.09 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3046  Smr domain-containing protein  34.09 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.641252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>