48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34039 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_34039  predicted protein  100 
 
 
113 aa  233  6e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.264513 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32698  predicted protein  38.37 
 
 
770 aa  74.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.782214  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  34.44 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46280  thioredoxin f  38.03 
 
 
174 aa  53.9  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767302  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  28.72 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  27.27 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26335  predicted protein  28.26 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  33.7 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  28.72 
 
 
120 aa  48.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  28.72 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  31.58 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  32.46 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  34.48 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  36.59 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  30.34 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  31.46 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  33.77 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31720  thioredoxin o  30.95 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.998916  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  31.82 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  36.05 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  31.17 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  33.7 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  28.57 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  32.26 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05590  thioredoxin, putative  24.76 
 
 
242 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.32051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  32.39 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  29.87 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  30.43 
 
 
122 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  31.52 
 
 
109 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  29.87 
 
 
132 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  29.87 
 
 
132 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  32.22 
 
 
241 aa  41.2  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  29.79 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  26.55 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  32.22 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  29.41 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  30.77 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  31.46 
 
 
269 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  31.52 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  26.8 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  35.06 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  29.87 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  29.35 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  32.99 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  30.23 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  30.85 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0770  Thioredoxin domain protein  30.68 
 
 
103 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>