43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2892 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2892  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  920    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1947  hypothetical protein  73.83 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  59.25 
 
 		 539 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1687  hypothetical protein  62.71 
 
 		 422 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2305  hypothetical protein  57.69 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  0.529594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1781  hypothetical protein  46.84 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0515  hypothetical protein  38.55 
 
 		 271 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000899408  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14470  hypothetical protein  44.39 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3493  hypothetical protein  43.81 
 
 		 593 aa  141  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.569085  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1698  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 379 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1551  DNA-binding protein  43.72 
 
 		 386 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1251  putative DNA-binding protein  42.78 
 
 		 755 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00288406  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16080  hypothetical protein  43.96 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1408  DNA-binding protein  41.26 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1627  hypothetical protein  37.5 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000844477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1633  hypothetical protein  37.04 
 
 		 502 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0509  hypothetical protein  37 
 
 		 356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.259003  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1257  hypothetical protein  34.81 
 
 		 349 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33870  hypothetical protein  40.21 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0828  DNA-binding protein  40.93 
 
 		 313 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1717  hypothetical protein  39.27 
 
 		 277 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0421  hypothetical protein  36.5 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.334792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0846  hypothetical protein  37.63 
 
 		 267 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1933  DNA-binding protein  36.3 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1413  hypothetical protein  36.81 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.95429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5034  hypothetical protein  38.38 
 
 		 270 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.974842  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10900  hypothetical protein  38.22 
 
 		 253 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5854  hypothetical protein  36.06 
 
 		 349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2916  DNA-binding protein  36.9 
 
 		 318 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000564769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15840  hypothetical protein  31.33 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.345115  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4710  hypothetical protein  33.84 
 
 		 343 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4552  hypothetical protein  36.14 
 
 		 279 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640966  normal  0.509604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4848  hypothetical protein  36.14 
 
 		 279 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4465  hypothetical protein  36.14 
 
 		 279 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1927  hypothetical protein  33.17 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0570762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13150  hypothetical protein  35.24 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.527633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  28.64 
 
 		 3521 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.18 
 
 		 2449 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  31.9 
 
 		 3471 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  31.9 
 
 		 3472 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  26.22 
 
 		 3409 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0305  hypothetical protein  26.69 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00254071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  21.15 
 
 		 1859 aa  45.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>