38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1927 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1927  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  745    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0570762  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1933  DNA-binding protein  36.45 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1698  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16080  hypothetical protein  35.61 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15840  hypothetical protein  33.92 
 
 		 342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.345115  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1413  hypothetical protein  31.94 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.95429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14470  hypothetical protein  42.25 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1551  DNA-binding protein  42.05 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2305  hypothetical protein  40 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  0.529594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1781  hypothetical protein  37.63 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  39.59 
 
 		 539 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1687  hypothetical protein  38.54 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3493  hypothetical protein  38.92 
 
 		 593 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.569085  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0509  hypothetical protein  35.23 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.259003  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0421  hypothetical protein  34.2 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.334792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1947  hypothetical protein  35.78 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1251  putative DNA-binding protein  37.93 
 
 		 755 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00288406  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2892  hypothetical protein  32.29 
 
 		 485 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0515  hypothetical protein  35.35 
 
 		 271 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000899408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1627  hypothetical protein  33.45 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000844477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5854  hypothetical protein  34.02 
 
 		 349 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1408  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 313 aa  93.6  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2916  DNA-binding protein  34.34 
 
 		 318 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000564769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1633  hypothetical protein  33.16 
 
 		 502 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0846  hypothetical protein  37 
 
 		 267 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33870  hypothetical protein  32.69 
 
 		 280 aa  89.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4465  hypothetical protein  32.16 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4552  hypothetical protein  32.16 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640966  normal  0.509604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4848  hypothetical protein  32.16 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10900  hypothetical protein  31.4 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5034  hypothetical protein  34.72 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.974842  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1717  hypothetical protein  32.66 
 
 		 277 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0828  DNA-binding protein  31.28 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1257  hypothetical protein  32.66 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4710  hypothetical protein  33 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0305  hypothetical protein  26.56 
 
 		 363 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00254071  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13150  hypothetical protein  29.95 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.527633  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0701  hypothetical protein  20.85 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>