24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0305 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0305  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  728    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00254071  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0701  hypothetical protein  40.7 
 
 
402 aa  261  1e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1933  DNA-binding protein  25.4 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1698  DNA-binding protein  31.52 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16080  hypothetical protein  26.56 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  28.3 
 
 
539 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1627  hypothetical protein  29.19 
 
 
463 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000844477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2305  hypothetical protein  27.75 
 
 
431 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  0.529594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1687  hypothetical protein  28.44 
 
 
422 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1927  hypothetical protein  26.56 
 
 
397 aa  56.2  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0570762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2916  DNA-binding protein  30.46 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000564769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1633  hypothetical protein  27.14 
 
 
502 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5854  hypothetical protein  26.04 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1251  putative DNA-binding protein  30.86 
 
 
755 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00288406  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3493  hypothetical protein  29.14 
 
 
593 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.569085  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0509  hypothetical protein  25.07 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.259003  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15840  hypothetical protein  24.1 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.345115  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1413  hypothetical protein  26.4 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.95429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1947  hypothetical protein  27 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33870  hypothetical protein  32.37 
 
 
280 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0421  hypothetical protein  25.52 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.334792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2892  hypothetical protein  25.89 
 
 
485 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10900  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14470  hypothetical protein  22.31 
 
 
449 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>