36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1257 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1257  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0515  hypothetical protein  60.21 
 
 
271 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000899408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33870  hypothetical protein  41.79 
 
 
280 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1717  hypothetical protein  55.24 
 
 
277 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131474  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10900  hypothetical protein  53.88 
 
 
253 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5034  hypothetical protein  55.71 
 
 
270 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.974842  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4465  hypothetical protein  51.87 
 
 
279 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4552  hypothetical protein  51.87 
 
 
279 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640966  normal  0.509604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4848  hypothetical protein  51.87 
 
 
279 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0846  hypothetical protein  38.11 
 
 
267 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4710  hypothetical protein  35.58 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1781  hypothetical protein  45.79 
 
 
395 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1687  hypothetical protein  40.62 
 
 
422 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  41.41 
 
 
539 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1947  hypothetical protein  32.39 
 
 
330 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2892  hypothetical protein  38.14 
 
 
485 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2305  hypothetical protein  40.27 
 
 
431 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  0.529594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3493  hypothetical protein  40.82 
 
 
593 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.569085  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1551  DNA-binding protein  39.02 
 
 
386 aa  119  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1408  DNA-binding protein  41.67 
 
 
313 aa  119  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1251  putative DNA-binding protein  40.61 
 
 
755 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00288406  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16080  hypothetical protein  36.56 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1698  DNA-binding protein  32.9 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0828  DNA-binding protein  40.11 
 
 
313 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14470  hypothetical protein  35.11 
 
 
449 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509261  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1627  hypothetical protein  35.64 
 
 
463 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000844477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2916  DNA-binding protein  39.66 
 
 
318 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000564769  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1413  hypothetical protein  36.57 
 
 
415 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.95429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1933  DNA-binding protein  30.93 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0509  hypothetical protein  34.87 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.259003  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15840  hypothetical protein  29.78 
 
 
342 aa  95.9  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.345115  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1633  hypothetical protein  32.14 
 
 
502 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5854  hypothetical protein  28.61 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1927  hypothetical protein  33.17 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0570762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13150  hypothetical protein  29.11 
 
 
471 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.527633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0305  hypothetical protein  26.26 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00254071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>