37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0846 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0846  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10900  hypothetical protein  49.07 
 
 
253 aa  231  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0515  hypothetical protein  49.45 
 
 
271 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000899408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33870  hypothetical protein  43.77 
 
 
280 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1717  hypothetical protein  46.01 
 
 
277 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131474  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4848  hypothetical protein  46.59 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4552  hypothetical protein  46.59 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640966  normal  0.509604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4465  hypothetical protein  46.59 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5034  hypothetical protein  47.84 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.974842  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1257  hypothetical protein  51.04 
 
 
349 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4710  hypothetical protein  39.2 
 
 
343 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1947  hypothetical protein  42.56 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2305  hypothetical protein  44.74 
 
 
431 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  0.529594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1781  hypothetical protein  43.52 
 
 
395 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  45.66 
 
 
539 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1687  hypothetical protein  43.01 
 
 
422 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2892  hypothetical protein  38.66 
 
 
485 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16080  hypothetical protein  38.91 
 
 
379 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0509  hypothetical protein  37.14 
 
 
356 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.259003  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1408  DNA-binding protein  42.78 
 
 
313 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0421  hypothetical protein  37.82 
 
 
354 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.334792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5854  hypothetical protein  39.29 
 
 
349 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0828  DNA-binding protein  41.71 
 
 
313 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14470  hypothetical protein  34.6 
 
 
449 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509261  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1413  hypothetical protein  40.86 
 
 
415 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.95429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1633  hypothetical protein  35.29 
 
 
502 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1698  DNA-binding protein  40.35 
 
 
379 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1251  putative DNA-binding protein  41.51 
 
 
755 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00288406  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1551  DNA-binding protein  38.95 
 
 
386 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3493  hypothetical protein  39.87 
 
 
593 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.569085  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2916  DNA-binding protein  36.68 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000564769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1627  hypothetical protein  38.18 
 
 
463 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000844477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1933  DNA-binding protein  40.12 
 
 
376 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15840  hypothetical protein  35.29 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.345115  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1927  hypothetical protein  37 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0570762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13150  hypothetical protein  39.62 
 
 
471 aa  56.6  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.527633  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0701  hypothetical protein  27 
 
 
402 aa  42  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>