35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1781 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1781  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  777    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1947  hypothetical protein  54.17 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  52.88 
 
 		 539 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2305  hypothetical protein  53.16 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  0.529594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1687  hypothetical protein  52.38 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1698  DNA-binding protein  51.87 
 
 		 379 aa  173  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2892  hypothetical protein  45.45 
 
 		 485 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1551  DNA-binding protein  51.56 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16080  hypothetical protein  45.41 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3493  hypothetical protein  47.92 
 
 		 593 aa  152  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.569085  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1413  hypothetical protein  31.54 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.95429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14470  hypothetical protein  43.98 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1251  putative DNA-binding protein  45.03 
 
 		 755 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00288406  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0515  hypothetical protein  46.51 
 
 		 271 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000899408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2916  DNA-binding protein  42.57 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000564769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0509  hypothetical protein  31.75 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.259003  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0421  hypothetical protein  37.95 
 
 		 354 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.334792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1633  hypothetical protein  39.22 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1627  hypothetical protein  40.2 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000844477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1257  hypothetical protein  45.79 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33870  hypothetical protein  43.11 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0846  hypothetical protein  43.81 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0828  DNA-binding protein  46.24 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1717  hypothetical protein  42.5 
 
 		 277 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1408  DNA-binding protein  42.78 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4710  hypothetical protein  42.26 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5034  hypothetical protein  43.12 
 
 		 270 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.974842  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10900  hypothetical protein  37.93 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15840  hypothetical protein  36.46 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.345115  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4552  hypothetical protein  40.11 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640966  normal  0.509604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4848  hypothetical protein  40.11 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4465  hypothetical protein  40.11 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1927  hypothetical protein  37.63 
 
 		 397 aa  93.2  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0570762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13150  hypothetical protein  39.19 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.527633  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0701  hypothetical protein  24.48 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>