37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0828 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0828  DNA-binding protein  100 
 
 		 313 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1687  hypothetical protein  44.62 
 
 		 422 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1947  hypothetical protein  43.78 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  41.71 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0515  hypothetical protein  44.29 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000899408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1781  hypothetical protein  46.24 
 
 		 395 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2305  hypothetical protein  43.01 
 
 		 431 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  0.529594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2892  hypothetical protein  40.93 
 
 		 485 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10900  hypothetical protein  39.01 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1717  hypothetical protein  41.71 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1698  DNA-binding protein  44.51 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33870  hypothetical protein  41.76 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0509  hypothetical protein  30.58 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.259003  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2916  DNA-binding protein  41.4 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000564769  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0421  hypothetical protein  35.86 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.334792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4848  hypothetical protein  45.13 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4465  hypothetical protein  45.13 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16080  hypothetical protein  39.56 
 
 		 379 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4552  hypothetical protein  45.13 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640966  normal  0.509604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3493  hypothetical protein  44.09 
 
 		 593 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.569085  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5034  hypothetical protein  35.31 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.974842  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1257  hypothetical protein  40.11 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1251  putative DNA-binding protein  44.62 
 
 		 755 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00288406  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1408  DNA-binding protein  38.32 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4710  hypothetical protein  39.01 
 
 		 343 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0846  hypothetical protein  41.71 
 
 		 267 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1551  DNA-binding protein  41.62 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1627  hypothetical protein  36.1 
 
 		 463 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000844477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1933  DNA-binding protein  40 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5854  hypothetical protein  37.7 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14470  hypothetical protein  37.84 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1633  hypothetical protein  36.99 
 
 		 502 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1413  hypothetical protein  32.84 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.95429 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15840  hypothetical protein  35.25 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.345115  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1927  hypothetical protein  33.16 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0570762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0701  hypothetical protein  24.29 
 
 		 402 aa  49.7  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0305  hypothetical protein  20.62 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00254071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>