36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1633 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1633  hypothetical protein  100 
 
 
502 aa  996    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1627  hypothetical protein  63.73 
 
 
463 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000844477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1698  DNA-binding protein  41.33 
 
 
379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13150  hypothetical protein  42.92 
 
 
471 aa  155  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.527633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16080  hypothetical protein  41.48 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1551  DNA-binding protein  39.03 
 
 
386 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1413  hypothetical protein  37.33 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.95429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1933  DNA-binding protein  37.25 
 
 
376 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1781  hypothetical protein  39.22 
 
 
395 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1687  hypothetical protein  39.05 
 
 
422 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1947  hypothetical protein  39.29 
 
 
330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2892  hypothetical protein  36.53 
 
 
485 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  38.16 
 
 
539 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0421  hypothetical protein  33.8 
 
 
354 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.334792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0509  hypothetical protein  34.91 
 
 
356 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.259003  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2305  hypothetical protein  37.86 
 
 
431 aa  124  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  0.529594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3493  hypothetical protein  36.23 
 
 
593 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.569085  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5854  hypothetical protein  34.12 
 
 
349 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2916  DNA-binding protein  31.87 
 
 
318 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000564769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15840  hypothetical protein  35.1 
 
 
342 aa  99.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.345115  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0515  hypothetical protein  36.7 
 
 
271 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000899408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0846  hypothetical protein  35.29 
 
 
267 aa  96.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10900  hypothetical protein  35.98 
 
 
253 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33870  hypothetical protein  34.64 
 
 
280 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1408  DNA-binding protein  39.39 
 
 
313 aa  90.9  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0828  DNA-binding protein  36.05 
 
 
313 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4465  hypothetical protein  35.08 
 
 
279 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4552  hypothetical protein  35.08 
 
 
279 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640966  normal  0.509604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4848  hypothetical protein  35.08 
 
 
279 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1717  hypothetical protein  33.16 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131474  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5034  hypothetical protein  33.16 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.974842  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1927  hypothetical protein  32.61 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0570762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1257  hypothetical protein  32.14 
 
 
349 aa  77  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4710  hypothetical protein  34.52 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0305  hypothetical protein  27.14 
 
 
363 aa  53.5  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00254071  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0701  hypothetical protein  28.97 
 
 
402 aa  47  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>