36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4848 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4465  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  554  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4552  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  554  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640966  normal  0.509604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4848  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  554  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1717  hypothetical protein  68.84 
 
 
277 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131474  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5034  hypothetical protein  69.29 
 
 
270 aa  338  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.974842  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10900  hypothetical protein  61.43 
 
 
253 aa  322  5e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0515  hypothetical protein  50.35 
 
 
271 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000899408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0846  hypothetical protein  49.28 
 
 
267 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33870  hypothetical protein  45.73 
 
 
280 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1257  hypothetical protein  52.86 
 
 
349 aa  212  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4710  hypothetical protein  36.29 
 
 
343 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1781  hypothetical protein  40.11 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1947  hypothetical protein  35.96 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14470  hypothetical protein  43.6 
 
 
449 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.509261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2892  hypothetical protein  36.87 
 
 
485 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0828  DNA-binding protein  45.13 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1551  DNA-binding protein  39.3 
 
 
386 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1698  DNA-binding protein  38.03 
 
 
379 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144324  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6783  hypothetical protein  32.97 
 
 
539 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701448  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1687  hypothetical protein  33.74 
 
 
422 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5854  hypothetical protein  34.19 
 
 
349 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3493  hypothetical protein  36.71 
 
 
593 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.569085  normal  0.623297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2916  DNA-binding protein  34.34 
 
 
318 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000564769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1251  putative DNA-binding protein  39.76 
 
 
755 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00288406  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1627  hypothetical protein  38.86 
 
 
463 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000844477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1408  DNA-binding protein  29.87 
 
 
313 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2305  hypothetical protein  35.53 
 
 
431 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  0.529594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0509  hypothetical protein  32.99 
 
 
356 aa  96.3  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.259003  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16080  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  95.5  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0421  hypothetical protein  32.99 
 
 
354 aa  94.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.334792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1413  hypothetical protein  34.3 
 
 
415 aa  93.6  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.95429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1633  hypothetical protein  35.08 
 
 
502 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1933  DNA-binding protein  33.92 
 
 
376 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.0954869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15840  hypothetical protein  36 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.345115  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1927  hypothetical protein  32.16 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0570762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13150  hypothetical protein  43.4 
 
 
471 aa  72.4  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.527633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>