More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0269 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0269  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000000107692  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0609  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0412  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0678  50S ribosomal protein L2  57.91 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.173189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  56.03 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  52.86 
 
 		 275 aa  288  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  54.32 
 
 		 274 aa  285  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1682  50S ribosomal protein L2  56.83 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0463749  hitchhiker  0.0000149038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3445  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 277 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0577  50S ribosomal protein L2  57.04 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  52.33 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  51.07 
 
 		 276 aa  279  4e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3664  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 		 278 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2739  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 278 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236416  normal  0.312063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5067  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 277 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.828543  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3181  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 		 278 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  49.64 
 
 		 276 aa  275  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  53.82 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  50.73 
 
 		 274 aa  275  7e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1548  50S ribosomal protein L2  54.74 
 
 		 277 aa  275  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  51.44 
 
 		 273 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  51.44 
 
 		 273 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1367  50S ribosomal protein L2  54.74 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.266089  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2298  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.749096  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1911  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00546363  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1943  50S ribosomal protein L2  55.76 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0350  50S ribosomal protein L2  56.47 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1357  50S ribosomal protein L2  56.69 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.184496  normal  0.0354969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  55.11 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  54.38 
 
 		 280 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  50 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0669  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 277 aa  272  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171407  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0701  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 277 aa  272  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 275 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  51.07 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  52.82 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  51.25 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  51.07 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  52.55 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1675  50S ribosomal protein L2  57.09 
 
 		 278 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  54.15 
 
 		 279 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  54.38 
 
 		 280 aa  267  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  55.47 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  51.27 
 
 		 277 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  51.82 
 
 		 275 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1843  50S ribosomal protein L2  55.64 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0328595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  50.36 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  51.8 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  48.91 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  50.55 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  53.6 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  51.64 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2165  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 		 278 aa  265  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.219576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2443  50S ribosomal protein L2  56.12 
 
 		 278 aa  265  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  50.71 
 
 		 276 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  54.38 
 
 		 279 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  54.74 
 
 		 279 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  54.74 
 
 		 279 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  53.28 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  50.91 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  53.6 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1193  50S ribosomal protein L2  54.74 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  50.55 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  50.55 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1792  50S ribosomal protein L2  54.74 
 
 		 278 aa  264  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109634  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  54.38 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2969  50S ribosomal protein L2  52.88 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2229  50S ribosomal protein L2  50.72 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.425308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  52.36 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2221  50S ribosomal protein L2  55.4 
 
 		 278 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  49.27 
 
 		 279 aa  261  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  50.91 
 
 		 277 aa  261  8e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  51.46 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  51.82 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  52.19 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  52.19 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  52.55 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1230  50S ribosomal protein L2  54.38 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.424988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  52.19 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  52.19 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  52.19 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  52.19 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  52.19 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  53.28 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  52.19 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2126  50S ribosomal protein L2  55.4 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  51.62 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  52.19 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  54.01 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  52.19 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>