More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1338 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1338  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  291  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1271  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.81 
 
 
201 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10134  normal  0.880841 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1340  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.88 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0189  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 
180 aa  94.4  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.77 
 
 
169 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.43 
 
 
153 aa  94  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.14 
 
 
173 aa  93.2  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35 
 
 
176 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.9 
 
 
641 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.26 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  38.26 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  38.26 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  38.26 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  38.26 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.26 
 
 
162 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  35.9 
 
 
639 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.9 
 
 
639 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.26 
 
 
639 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2433  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.98 
 
 
204 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  34.91 
 
 
180 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  39.26 
 
 
639 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  39.26 
 
 
639 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4499  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.54 
 
 
192 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.249413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0071  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.72 
 
 
189 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1426  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.92 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.33 
 
 
671 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.33 
 
 
671 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3949  4Fe-4S binding domain protein  36.67 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.26 
 
 
644 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  31.43 
 
 
1087 aa  87  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  34.19 
 
 
659 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  34.19 
 
 
659 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.54 
 
 
188 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  34.19 
 
 
659 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.19 
 
 
659 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.19 
 
 
659 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.19 
 
 
659 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.14 
 
 
180 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.05 
 
 
177 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03425  predicted hydrogenase, 4Fe-4S ferredoxin-type component  35.33 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.33 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.75 
 
 
659 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  35.33 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0141  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.33 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.33 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.75 
 
 
659 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03376  hypothetical protein  35.33 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.33 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0608  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.16 
 
 
193 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.832632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2051  nitrate reductase electron transfer subunit  31.62 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1766  nitrate reductase electron transfer subunit  31.62 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3004  formate hydrogenlyase subunit B  31.64 
 
 
202 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521869 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3055  formate hydrogenlyase subunit B  31.64 
 
 
202 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2973  formate hydrogenlyase, subunit B  31.64 
 
 
202 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3039  formate hydrogenlyase subunit B  31.64 
 
 
202 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.57 
 
 
180 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
203 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0586369  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.59 
 
 
658 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.53 
 
 
157 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.93 
 
 
176 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  33.9 
 
 
181 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  34.46 
 
 
181 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27580  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  35.66 
 
 
192 aa  83.6  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3162  formate hydrogenlyase, subunit B  31.07 
 
 
202 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.263749 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02574  hydrogenase 3, Fe-S subunit  31.64 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.64 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3038  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.18 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  34.46 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.64 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  34.46 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  34.46 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2849  formate hydrogenlyase, subunit B  31.64 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3975  formate hydrogenlyase, subunit B  31.64 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2860  formate hydrogenlyase, subunit B  31.64 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02539  hypothetical protein  31.64 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2631  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.81 
 
 
491 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.71 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  29.67 
 
 
185 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.55 
 
 
202 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.77 
 
 
653 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0607  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.67 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.819324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3152  formate hydrogenlyase, subunit B  31.64 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.77 
 
 
653 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2994  electron transport protein HydN  33.9 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00426754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  29.67 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.77 
 
 
653 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.67 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24630  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  36.96 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.538569  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2085  iron-sulfur cluster-binding protein  37.78 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0439834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2000  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.67 
 
 
190 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.85937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  34.32 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  34.32 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.32 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  34.32 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  34.32 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  34.32 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.77 
 
 
653 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  34.32 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  34.32 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  34.32 
 
 
175 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>