23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1320 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  100 
 
 		 127 aa  253  8e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  51.24 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  51.24 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  41.6 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  45.53 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  41.13 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  36.51 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  43.55 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  41.27 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0729  SSU processome protein Utp24  41.46 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.857115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0246  nucleotide binding protein, PINc  35.65 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  30.51 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  38.52 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0258  nucleotide binding protein, PINc  37.82 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000462302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  29.55 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  33.86 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  29.92 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0923  PilT domain-containing protein  34.45 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.223217 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1989  PilT domain-containing protein  34.19 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1331  hypothetical protein  26.19 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.308209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  34.91 
 
 		 361 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0896  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.996154  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1390  Nucleotide binding protein PINc  30.4 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>