17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0729 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0729  SSU processome protein Utp24  100 
 
 		 125 aa  245  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.857115 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  66.67 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  59.2 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  57.6 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  55.2 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  44.17 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  42.74 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  43.09 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  32.52 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  36.36 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  38.79 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0246  nucleotide binding protein, PINc  35.9 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  36.36 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  27.64 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  25.2 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0653  nucleotide binding protein PINc  25.86 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198585  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1331  hypothetical protein  24.66 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.308209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>