20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2397 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2397  PilT N-term./Vapc superfamily-like protein  100 
 
 		 153 aa  289  9e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1487  Nucleotide binding protein PINc  66.13 
 
 		 128 aa  150  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.348879  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3453  hypothetical protein  66.94 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2208  rpo operon protein  57.85 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.968632  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0729  SSU processome protein Utp24  55.12 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.857115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0286  hypothetical protein  38.66 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2862  nucleotide binding protein, PINc  32.2 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00180077  normal  0.707644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0604  nucleotide binding protein, PINc  37.5 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2279  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000036024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2241  nucleotide binding protein, PINc  36.29 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0710  nucleotide binding protein PINc  28.8 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000342906  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1320  nucleotide binding protein, PINc  38.52 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443284  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1118  Protein of unknown function DUF652  34.71 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00355595  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0246  nucleotide binding protein, PINc  35.65 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0587  nucleotide binding protein PINc  27.37 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.579248  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0653  nucleotide binding protein PINc  25.22 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.198585  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10865  DUF652 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03340)  30.33 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27263  predicted protein  29.79 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00400  EMG2  54.9 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1331  hypothetical protein  25.35 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.308209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>